More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0447 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  51.6 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.29 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.29 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  62.46 
 
 		 671 aa  801    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  57.43 
 
 		 653 aa  720    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  51.4 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  71.65 
 
 		 657 aa  886    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  53.5 
 
 		 660 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  48.82 
 
 		 690 aa  673    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  53 
 
 		 671 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  58.85 
 
 		 672 aa  758    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  63.31 
 
 		 695 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  59.72 
 
 		 657 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  58.14 
 
 		 665 aa  755    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  62.58 
 
 		 663 aa  832    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  71.36 
 
 		 657 aa  877    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  51.6 
 
 		 665 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  59.53 
 
 		 651 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  62.58 
 
 		 738 aa  830    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.99 
 
 		 663 aa  833    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  63 
 
 		 670 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  51.6 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  54.96 
 
 		 653 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.55 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  61.78 
 
 		 684 aa  826    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  58.91 
 
 		 681 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  55.24 
 
 		 672 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  51.6 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  52.48 
 
 		 661 aa  715    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  53.67 
 
 		 655 aa  637    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  58.35 
 
 		 661 aa  744    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  57.19 
 
 		 666 aa  792    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  51.48 
 
 		 694 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  57.94 
 
 		 658 aa  745    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  49.85 
 
 		 681 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  54.94 
 
 		 672 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  72.29 
 
 		 657 aa  889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  54.49 
 
 		 672 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  100 
 
 		 671 aa  1359    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  71.94 
 
 		 668 aa  896    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  53.3 
 
 		 671 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.8 
 
 		 665 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  51.29 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  51.44 
 
 		 663 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  51.44 
 
 		 663 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  52.4 
 
 		 666 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  52.8 
 
 		 668 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  58.99 
 
 		 657 aa  756    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  62.65 
 
 		 660 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  59.32 
 
 		 677 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  62.52 
 
 		 671 aa  803    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  58.27 
 
 		 662 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  60.22 
 
 		 655 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  52.94 
 
 		 663 aa  726    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  55.77 
 
 		 671 aa  740    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  59.09 
 
 		 657 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  63.94 
 
 		 673 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  57.01 
 
 		 686 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  58.97 
 
 		 681 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.82 
 
 		 667 aa  776    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  58.38 
 
 		 661 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.67 
 
 		 663 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.29 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  62.42 
 
 		 671 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  57.5 
 
 		 662 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  51.1 
 
 		 680 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.44 
 
 		 663 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  57.45 
 
 		 678 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.58 
 
 		 666 aa  746    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  51.75 
 
 		 663 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  51.6 
 
 		 663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  51.44 
 
 		 663 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  52.84 
 
 		 673 aa  688    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  61.05 
 
 		 660 aa  775    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  58.27 
 
 		 661 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  60.81 
 
 		 655 aa  773    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  58.91 
 
 		 681 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.31 
 
 		 686 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50 
 
 		 662 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.29 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.45 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  53.67 
 
 		 665 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  57.65 
 
 		 663 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  58.98 
 
 		 660 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.55 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  51.79 
 
 		 663 aa  641    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.22 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.37 
 
 		 667 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  52.18 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.38 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.77 
 
 		 666 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  54.1 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  51.22 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  51.52 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  52.45 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  53.57 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  51.11 
 
 		 668 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  51.61 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>