More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3268 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  52.5 
 
 		 671 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  60.37 
 
 		 658 aa  786    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  61.37 
 
 		 738 aa  808    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  58.41 
 
 		 661 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.28 
 
 		 663 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.66 
 
 		 690 aa  644    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  52.04 
 
 		 660 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  52.66 
 
 		 671 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  63.55 
 
 		 695 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  61.37 
 
 		 663 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  52.27 
 
 		 664 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  58.07 
 
 		 665 aa  733    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  59.53 
 
 		 657 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  60 
 
 		 651 aa  766    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  60.96 
 
 		 655 aa  759    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  72.29 
 
 		 671 aa  942    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.19 
 
 		 665 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  51.38 
 
 		 661 aa  691    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  52.21 
 
 		 661 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  57.34 
 
 		 661 aa  729    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.88 
 
 		 653 aa  698    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.66 
 
 		 681 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  58.32 
 
 		 672 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  100 
 
 		 657 aa  1327    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  99.24 
 
 		 657 aa  1316    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  52.81 
 
 		 666 aa  655    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  63.75 
 
 		 684 aa  830    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  64.32 
 
 		 670 aa  799    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  59.66 
 
 		 663 aa  734    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.72 
 
 		 680 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  91.48 
 
 		 657 aa  1118    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  51.49 
 
 		 663 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  64.38 
 
 		 660 aa  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.32 
 
 		 694 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  62.5 
 
 		 667 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  64.62 
 
 		 671 aa  828    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  58.56 
 
 		 662 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  60.4 
 
 		 655 aa  755    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.39 
 
 		 663 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  59.42 
 
 		 671 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  52.73 
 
 		 675 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  64.21 
 
 		 673 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  57.95 
 
 		 686 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  58.22 
 
 		 681 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  58.94 
 
 		 666 aa  810    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  51.28 
 
 		 664 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  64.46 
 
 		 671 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  58.1 
 
 		 662 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  60.33 
 
 		 657 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.97 
 
 		 663 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  56.02 
 
 		 678 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  58.75 
 
 		 677 aa  724    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  57.25 
 
 		 672 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  58.02 
 
 		 672 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  56.62 
 
 		 673 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  59.91 
 
 		 660 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  58.37 
 
 		 681 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.38 
 
 		 666 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.7 
 
 		 686 aa  790    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  52.04 
 
 		 664 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  58.41 
 
 		 661 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  58.77 
 
 		 660 aa  735    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  64.77 
 
 		 671 aa  830    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.98 
 
 		 666 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  58.37 
 
 		 681 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  60.16 
 
 		 657 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  62.38 
 
 		 672 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  73.79 
 
 		 668 aa  940    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  52.5 
 
 		 665 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  52.5 
 
 		 663 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.13 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.12 
 
 		 670 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.12 
 
 		 670 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.13 
 
 		 665 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  54.09 
 
 		 668 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.45 
 
 		 663 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  50.59 
 
 		 665 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.11 
 
 		 667 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  51.44 
 
 		 665 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.93 
 
 		 666 aa  635  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.94 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.61 
 
 		 665 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  51.98 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  51.75 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  51.75 
 
 		 663 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.76 
 
 		 723 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  51.75 
 
 		 663 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  52.01 
 
 		 653 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  50.89 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  51.75 
 
 		 663 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  51.52 
 
 		 664 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.15 
 
 		 665 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  50.91 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  50.15 
 
 		 677 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.85 
 
 		 662 aa  628  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>