More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3531 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  52.41 
 
 		 667 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.13 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  52.41 
 
 		 667 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  52.41 
 
 		 667 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.08 
 
 		 663 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.04 
 
 		 670 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.04 
 
 		 670 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  50.29 
 
 		 690 aa  688    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  59.3 
 
 		 671 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  65.34 
 
 		 665 aa  877    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.98 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  61.61 
 
 		 663 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  55.96 
 
 		 657 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  50.94 
 
 		 690 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  50.94 
 
 		 690 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  48.8 
 
 		 668 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  50.98 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.59 
 
 		 665 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  52.26 
 
 		 667 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  52.41 
 
 		 667 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  53.54 
 
 		 672 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  51.51 
 
 		 664 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  61.66 
 
 		 651 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  61.85 
 
 		 738 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  49.93 
 
 		 661 aa  667    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  50.68 
 
 		 663 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  90.3 
 
 		 661 aa  1218    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  50.94 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  50.94 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  52.41 
 
 		 664 aa  664    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  54.6 
 
 		 672 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  56.02 
 
 		 657 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  51.23 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  58.61 
 
 		 666 aa  805    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  50.83 
 
 		 663 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  52.35 
 
 		 662 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.22 
 
 		 680 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.72 
 
 		 675 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  54.3 
 
 		 672 aa  713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  52.56 
 
 		 664 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  56.92 
 
 		 660 aa  702    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  55.96 
 
 		 666 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  76.97 
 
 		 661 aa  1042    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.86 
 
 		 653 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  58.64 
 
 		 671 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  77.88 
 
 		 662 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  56.04 
 
 		 655 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  686    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  53.95 
 
 		 671 aa  708    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  57.45 
 
 		 671 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  59.85 
 
 		 673 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  77.46 
 
 		 686 aa  1061    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  52.41 
 
 		 667 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  55.57 
 
 		 657 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.63 
 
 		 694 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  52.41 
 
 		 667 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.76 
 
 		 667 aa  755    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  54.57 
 
 		 695 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  59.09 
 
 		 671 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  77.12 
 
 		 662 aa  1010    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.64 
 
 		 677 aa  728    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  51.09 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  100 
 
 		 678 aa  1389    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  51.51 
 
 		 664 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  62.42 
 
 		 684 aa  815    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  56.24 
 
 		 655 aa  719    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  57.77 
 
 		 670 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  50.68 
 
 		 663 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50.94 
 
 		 696 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  54.12 
 
 		 673 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  53.91 
 
 		 660 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.09 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  55.81 
 
 		 681 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  55.66 
 
 		 681 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.74 
 
 		 686 aa  791    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  50.29 
 
 		 690 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  52.56 
 
 		 664 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  60.7 
 
 		 663 aa  801    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51.93 
 
 		 666 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.17 
 
 		 665 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  70.5 
 
 		 661 aa  918    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  54.49 
 
 		 660 aa  710    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  50.14 
 
 		 690 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  61.72 
 
 		 657 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.09 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  55.81 
 
 		 681 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.21 
 
 		 663 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  50.94 
 
 		 690 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  56.73 
 
 		 672 aa  719    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  54.99 
 
 		 668 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  56.55 
 
 		 657 aa  732    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>