More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2734 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3638  transketolase  59.02 
 
 		 658 aa  772    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.3 
 
 		 663 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.54 
 
 		 667 aa  759    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  51.35 
 
 		 664 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  60.8 
 
 		 663 aa  801    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  60.15 
 
 		 671 aa  776    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  62.56 
 
 		 657 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  50.51 
 
 		 690 aa  688    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  50.82 
 
 		 699 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  51.19 
 
 		 696 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  52.97 
 
 		 653 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  57.08 
 
 		 668 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  63.07 
 
 		 663 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  76.06 
 
 		 661 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  52.25 
 
 		 664 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  56.17 
 
 		 655 aa  722    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  62.4 
 
 		 657 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.23 
 
 		 663 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  51.35 
 
 		 664 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  62.52 
 
 		 684 aa  827    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  52.25 
 
 		 664 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.64 
 
 		 677 aa  730    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  56.86 
 
 		 672 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.46 
 
 		 661 aa  659    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  51.58 
 
 		 663 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  100 
 
 		 661 aa  1357    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  54.22 
 
 		 672 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  54.64 
 
 		 657 aa  708    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  50.38 
 
 		 666 aa  638    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  54.37 
 
 		 672 aa  705    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  57.34 
 
 		 657 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  56.27 
 
 		 666 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  51.49 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  51.35 
 
 		 664 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.19 
 
 		 675 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  51.2 
 
 		 664 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  66.16 
 
 		 665 aa  888    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  50.3 
 
 		 663 aa  636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  59.09 
 
 		 666 aa  815    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  52.21 
 
 		 671 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  57.54 
 
 		 660 aa  710    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.76 
 
 		 694 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  52.4 
 
 		 664 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.86 
 
 		 653 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  59.24 
 
 		 671 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  77.31 
 
 		 662 aa  1042    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  55.67 
 
 		 655 aa  726    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.7 
 
 		 663 aa  681    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  54.19 
 
 		 671 aa  698    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  63.22 
 
 		 738 aa  834    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  58.35 
 
 		 671 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  59.27 
 
 		 673 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  77.27 
 
 		 686 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  52.21 
 
 		 671 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  53.16 
 
 		 672 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  62.58 
 
 		 651 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.67 
 
 		 680 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  59.39 
 
 		 671 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  76.85 
 
 		 662 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  90.3 
 
 		 678 aa  1196    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  51.35 
 
 		 664 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.47 
 
 		 663 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  56.57 
 
 		 681 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  57.19 
 
 		 657 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  52.86 
 
 		 673 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  54.21 
 
 		 660 aa  701    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  56.73 
 
 		 681 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  62.17 
 
 		 686 aa  804    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  52.1 
 
 		 664 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  50.68 
 
 		 657 aa  648    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  54.87 
 
 		 695 aa  708    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  56.42 
 
 		 670 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.55 
 
 		 666 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.69 
 
 		 665 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  57.49 
 
 		 657 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  54.95 
 
 		 660 aa  722    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.49 
 
 		 690 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  56.73 
 
 		 681 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  70.39 
 
 		 661 aa  922    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  50.45 
 
 		 662 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.38 
 
 		 723 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  50.6 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  51.06 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.23 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>