More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6387 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  50.68 
 
 		 667 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  56.27 
 
 		 658 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  53.04 
 
 		 657 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  51.37 
 
 		 692 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.05 
 
 		 665 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.26 
 
 		 670 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.18 
 
 		 670 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  51.01 
 
 		 690 aa  708    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.68 
 
 		 677 aa  703    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  58.22 
 
 		 657 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  54.89 
 
 		 665 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  57.95 
 
 		 663 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  58.97 
 
 		 657 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.2 
 
 		 666 aa  737    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  57.95 
 
 		 738 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  58.38 
 
 		 671 aa  772    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  50.6 
 
 		 666 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.6 
 
 		 680 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  50.83 
 
 		 667 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  51.75 
 
 		 660 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.75 
 
 		 665 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  56.95 
 
 		 695 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  50.67 
 
 		 668 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  51.56 
 
 		 665 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  51.13 
 
 		 662 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  58.91 
 
 		 671 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  51.31 
 
 		 661 aa  674    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.91 
 
 		 661 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  56.73 
 
 		 661 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  58.37 
 
 		 663 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  57.01 
 
 		 684 aa  758    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  50.82 
 
 		 665 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  50.3 
 
 		 681 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  51.67 
 
 		 672 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  58.37 
 
 		 657 aa  703    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  55.73 
 
 		 661 aa  718    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  97.65 
 
 		 681 aa  1317    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.6 
 
 		 694 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  54.07 
 
 		 668 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  51.37 
 
 		 672 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  52.02 
 
 		 665 aa  670    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  59.56 
 
 		 660 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.23 
 
 		 664 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  50.75 
 
 		 666 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  59.24 
 
 		 671 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  56.23 
 
 		 662 aa  720    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  51.9 
 
 		 655 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  50.7 
 
 		 663 aa  688    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  51.28 
 
 		 671 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  50.46 
 
 		 672 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  50.75 
 
 		 665 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  59.64 
 
 		 673 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  55.66 
 
 		 686 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  51.36 
 
 		 663 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.05 
 
 		 665 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  57.52 
 
 		 657 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.64 
 
 		 723 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  57.8 
 
 		 651 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  54.76 
 
 		 653 aa  703    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  58.78 
 
 		 671 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  54.83 
 
 		 662 aa  703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.78 
 
 		 670 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.08 
 
 		 663 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  55.81 
 
 		 678 aa  722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  57.8 
 
 		 667 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  48.19 
 
 		 665 aa  640    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  54.74 
 
 		 661 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  57.88 
 
 		 663 aa  772    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  49.47 
 
 		 673 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  53.55 
 
 		 660 aa  674    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.59 
 
 		 666 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  100 
 
 		 681 aa  1399    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  58.64 
 
 		 686 aa  760    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.85 
 
 		 662 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  50.6 
 
 		 664 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.83 
 
 		 664 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  50.83 
 
 		 664 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.02 
 
 		 666 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.27 
 
 		 665 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  52.87 
 
 		 655 aa  685    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  53.54 
 
 		 660 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  51.49 
 
 		 665 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  99.85 
 
 		 681 aa  1395    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.83 
 
 		 664 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  55.5 
 
 		 672 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  55.5 
 
 		 668 aa  700    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>