More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1697 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1193  transketolase  61.93 
 
 		 667 aa  808    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  56.27 
 
 		 681 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  63.41 
 
 		 671 aa  820    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  59.72 
 
 		 672 aa  772    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  52.27 
 
 		 665 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  74.69 
 
 		 657 aa  906    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  56.97 
 
 		 661 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  60.45 
 
 		 663 aa  820    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  57.96 
 
 		 665 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  51.35 
 
 		 671 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  65.54 
 
 		 670 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.88 
 
 		 653 aa  714    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  60.8 
 
 		 658 aa  788    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  61.21 
 
 		 684 aa  808    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  73.48 
 
 		 657 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  52.11 
 
 		 663 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.46 
 
 		 661 aa  687    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.45 
 
 		 661 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  56.92 
 
 		 661 aa  742    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  58.51 
 
 		 655 aa  741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  71.94 
 
 		 671 aa  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  51.73 
 
 		 665 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  57.75 
 
 		 672 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  73.94 
 
 		 657 aa  912    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  60.28 
 
 		 663 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.68 
 
 		 663 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  57.03 
 
 		 666 aa  792    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  59.39 
 
 		 663 aa  751    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  52.41 
 
 		 666 aa  668    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  61.47 
 
 		 695 aa  804    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  57.16 
 
 		 657 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  51.65 
 
 		 680 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  60.56 
 
 		 660 aa  741    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  57.21 
 
 		 677 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  51.72 
 
 		 694 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  62.31 
 
 		 671 aa  816    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  57.21 
 
 		 662 aa  735    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  59.01 
 
 		 655 aa  748    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  676    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  55.64 
 
 		 671 aa  737    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  62.5 
 
 		 673 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  55.79 
 
 		 686 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  60.45 
 
 		 738 aa  819    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  51.65 
 
 		 671 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  61.87 
 
 		 671 aa  821    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  56.9 
 
 		 662 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.64 
 
 		 663 aa  638    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  55.21 
 
 		 678 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  52.18 
 
 		 675 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  56.95 
 
 		 661 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  61.53 
 
 		 657 aa  779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  53.73 
 
 		 673 aa  703    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  58.16 
 
 		 660 aa  715    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  100 
 
 		 668 aa  1352    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  56.12 
 
 		 681 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.37 
 
 		 666 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.65 
 
 		 686 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  57.75 
 
 		 672 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  61.06 
 
 		 657 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.94 
 
 		 666 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  53.92 
 
 		 665 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  57.21 
 
 		 660 aa  734    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  60.59 
 
 		 651 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  56.38 
 
 		 666 aa  737    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  57.1 
 
 		 672 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  56.12 
 
 		 681 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.7 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.9 
 
 		 670 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.9 
 
 		 670 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.08 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.12 
 
 		 723 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.05 
 
 		 667 aa  630  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.08 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  50.6 
 
 		 665 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  628  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  52.13 
 
 		 665 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  51.67 
 
 		 668 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.73 
 
 		 664 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  48.71 
 
 		 663 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  49.85 
 
 		 692 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  52.45 
 
 		 663 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.47 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.47 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  46.81 
 
 		 690 aa  623  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  49.62 
 
 		 663 aa  625  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.47 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.62 
 
 		 663 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  51.59 
 
 		 659 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  49.77 
 
 		 657 aa  625  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.07 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>