More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2980 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  60.82 
 
 		 667 aa  826    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  64.9 
 
 		 663 aa  896    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  64.9 
 
 		 663 aa  896    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  60.82 
 
 		 667 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.61 
 
 		 666 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.61 
 
 		 666 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  63.64 
 
 		 665 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2479  transketolase  53.39 
 
 		 664 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  59.91 
 
 		 662 aa  824    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  65.47 
 
 		 670 aa  867    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  65.27 
 
 		 670 aa  867    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  64.55 
 
 		 664 aa  873    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  85.87 
 
 		 675 aa  1152    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  64.78 
 
 		 663 aa  861    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  63.64 
 
 		 665 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  62.01 
 
 		 662 aa  848    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  67.9 
 
 		 678 aa  895    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  52.42 
 
 		 663 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  64.39 
 
 		 664 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  64.11 
 
 		 665 aa  864    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  65.3 
 
 		 664 aa  888    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  66.87 
 
 		 664 aa  905    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  68.14 
 
 		 695 aa  909    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  65.76 
 
 		 664 aa  890    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  64.95 
 
 		 664 aa  884    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  59.46 
 
 		 666 aa  817    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  967    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  55.87 
 
 		 668 aa  755    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  55.27 
 
 		 668 aa  751    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  63.33 
 
 		 665 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  59.61 
 
 		 665 aa  809    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  65.11 
 
 		 668 aa  864    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  60.42 
 
 		 690 aa  787    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  53.08 
 
 		 663 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  90.41 
 
 		 677 aa  1242    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  967    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  68.79 
 
 		 661 aa  936    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  73.1 
 
 		 657 aa  1021    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  65.36 
 
 		 666 aa  862    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  71.62 
 
 		 690 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  63.51 
 
 		 665 aa  848    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  64.72 
 
 		 681 aa  867    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  66.82 
 
 		 680 aa  898    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  62.69 
 
 		 664 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  955    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  71.47 
 
 		 675 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  65.01 
 
 		 680 aa  893    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  61.33 
 
 		 664 aa  824    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  60.18 
 
 		 662 aa  819    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  63.6 
 
 		 693 aa  860    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  65.01 
 
 		 694 aa  893    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  71.62 
 
 		 690 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1913  transketolase  61.64 
 
 		 695 aa  803    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.597375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  69.09 
 
 		 671 aa  934    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  53.68 
 
 		 666 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  60.45 
 
 		 682 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  71.62 
 
 		 690 aa  945    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  54.5 
 
 		 671 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  71.77 
 
 		 696 aa  971    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.31 
 
 		 655 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  61.82 
 
 		 667 aa  835    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  52.42 
 
 		 738 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  65.33 
 
 		 693 aa  863    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  65.01 
 
 		 667 aa  872    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.62 
 
 		 673 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  65.78 
 
 		 681 aa  892    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  65.61 
 
 		 663 aa  894    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  60.36 
 
 		 693 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  67.5 
 
 		 674 aa  903    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  71.19 
 
 		 662 aa  947    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  65.91 
 
 		 680 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  64.55 
 
 		 664 aa  879    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.38 
 
 		 671 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  65.47 
 
 		 693 aa  831    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  60.57 
 
 		 663 aa  776    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  62.14 
 
 		 663 aa  832    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  63.27 
 
 		 692 aa  834    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  59.64 
 
 		 665 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  61.88 
 
 		 684 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  100 
 
 		 659 aa  1355    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  56.71 
 
 		 665 aa  783    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  63.8 
 
 		 666 aa  865    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  956    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  61.12 
 
 		 668 aa  792    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  63.75 
 
 		 666 aa  865    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  63.29 
 
 		 666 aa  871    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  54.56 
 
 		 670 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  63.5 
 
 		 662 aa  869    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  64.3 
 
 		 663 aa  879    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  65.45 
 
 		 664 aa  891    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  65.3 
 
 		 664 aa  888    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  60.31 
 
 		 666 aa  804    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  60.76 
 
 		 665 aa  811    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  64.24 
 
 		 680 aa  862    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  65.03 
 
 		 723 aa  875    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  70.87 
 
 		 690 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  65.49 
 
 		 665 aa  881    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  64.7 
 
 		 664 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  71.47 
 
 		 690 aa  956    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>