More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1195 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  60.66 
 
 
667 aa  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  64.08 
 
 
663 aa  877    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  64.08 
 
 
663 aa  877    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  60.66 
 
 
667 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.89 
 
 
666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.89 
 
 
666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  62.65 
 
 
665 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  56.93 
 
 
668 aa  746    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  65.33 
 
 
670 aa  884    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  65.33 
 
 
670 aa  884    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.83 
 
 
690 aa  639    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  72.58 
 
 
675 aa  962    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  62.07 
 
 
692 aa  827    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.78 
 
 
666 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  61.1 
 
 
662 aa  836    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  62.56 
 
 
693 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  52.47 
 
 
663 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  64.23 
 
 
664 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  63.86 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  66.03 
 
 
678 aa  867    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.78 
 
 
666 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  67.2 
 
 
680 aa  897    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.63 
 
 
666 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  96.09 
 
 
690 aa  1373    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.63 
 
 
666 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  96.09 
 
 
690 aa  1373    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  57.29 
 
 
668 aa  770    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  56.69 
 
 
668 aa  762    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  64.38 
 
 
693 aa  830    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  63.4 
 
 
665 aa  867    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  58.99 
 
 
665 aa  798    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  64.01 
 
 
668 aa  857    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  59.7 
 
 
690 aa  787    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.11 
 
 
670 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  71.47 
 
 
677 aa  979    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  64.98 
 
 
664 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  67.71 
 
 
661 aa  926    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.05 
 
 
670 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.34 
 
 
670 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  96.23 
 
 
690 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  63.12 
 
 
665 aa  863    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  60.9 
 
 
681 aa  842    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  64.51 
 
 
663 aa  856    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  92.46 
 
 
690 aa  1316    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  92.61 
 
 
690 aa  1323    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  66.23 
 
 
695 aa  880    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  60.51 
 
 
662 aa  827    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.1 
 
 
669 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  60.12 
 
 
664 aa  792    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  61.2 
 
 
662 aa  830    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  96.09 
 
 
690 aa  1373    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.78 
 
 
666 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  96.09 
 
 
696 aa  1374    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.74 
 
 
668 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  67.37 
 
 
671 aa  904    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  60.27 
 
 
664 aa  794    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  59.19 
 
 
682 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  100 
 
 
690 aa  1418    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  54.42 
 
 
671 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.81 
 
 
669 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.31 
 
 
655 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.63 
 
 
670 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  96.23 
 
 
690 aa  1375    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  63.52 
 
 
693 aa  824    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  63.47 
 
 
667 aa  856    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.85 
 
 
673 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  64.68 
 
 
664 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  64.18 
 
 
663 aa  884    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  60.12 
 
 
693 aa  813    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  64.64 
 
 
674 aa  857    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  84.62 
 
 
662 aa  1157    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  69.97 
 
 
680 aa  960    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  63.34 
 
 
664 aa  855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  54.04 
 
 
671 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  62.07 
 
 
667 aa  830    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  60.12 
 
 
663 aa  766    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  62.52 
 
 
663 aa  835    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  96 
 
 
675 aa  1342    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  58.84 
 
 
665 aa  794    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  63.21 
 
 
684 aa  841    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  71.62 
 
 
659 aa  967    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  56.72 
 
 
665 aa  792    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  63 
 
 
681 aa  857    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.09 
 
 
667 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  62.65 
 
 
664 aa  859    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  92.46 
 
 
690 aa  1316    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  64.68 
 
 
664 aa  877    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  62.97 
 
 
666 aa  851    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  63.43 
 
 
666 aa  871    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  68.27 
 
 
657 aa  946    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  64.07 
 
 
662 aa  876    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  64.21 
 
 
666 aa  859    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  64.53 
 
 
664 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  64.53 
 
 
664 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  60.33 
 
 
666 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  60.57 
 
 
665 aa  798    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  62.85 
 
 
680 aa  850    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  63.64 
 
 
663 aa  861    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  91.88 
 
 
690 aa  1314    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  64.16 
 
 
665 aa  876    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>