More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1127 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50 
 
 
669 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.34 
 
 
680 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2246  transketolase  65.93 
 
 
708 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304572 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  47.83 
 
 
669 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  70.39 
 
 
723 aa  974    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  49.25 
 
 
666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  49.25 
 
 
666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2262  transketolase  63.85 
 
 
707 aa  843    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000167932  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  66.09 
 
 
697 aa  941    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.33 
 
 
668 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15270  transketolase  59.56 
 
 
698 aa  824    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0942256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2374  transketolase  62.83 
 
 
695 aa  842    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  49.77 
 
 
664 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.19 
 
 
666 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1557  transketolase  59.32 
 
 
702 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.52 
 
 
711 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.04 
 
 
680 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.03 
 
 
674 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.04 
 
 
666 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49.92 
 
 
664 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.19 
 
 
666 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.85 
 
 
664 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.19 
 
 
666 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.04 
 
 
666 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  47.22 
 
 
668 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.43 
 
 
675 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  68.93 
 
 
741 aa  966    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  51.46 
 
 
691 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  52.56 
 
 
691 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.47 
 
 
664 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  68.26 
 
 
707 aa  962    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  49.19 
 
 
681 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0442  transketolase  51.87 
 
 
702 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.369488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  54.16 
 
 
662 aa  654    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.49 
 
 
666 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.05 
 
 
672 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  48.04 
 
 
666 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  52.15 
 
 
664 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  65.54 
 
 
697 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.09 
 
 
684 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  57.68 
 
 
682 aa  737    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  48.66 
 
 
669 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  71.02 
 
 
708 aa  996    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  48.35 
 
 
668 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.03 
 
 
674 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.04 
 
 
666 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  47.9 
 
 
668 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  49.7 
 
 
668 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  63.24 
 
 
700 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  50.36 
 
 
707 aa  673    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  55.83 
 
 
674 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  49.85 
 
 
664 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  53.2 
 
 
676 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  53.2 
 
 
676 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  50.38 
 
 
664 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  48.81 
 
 
670 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  48.2 
 
 
668 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  50.08 
 
 
664 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  55.16 
 
 
678 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2454  transketolase  61.83 
 
 
697 aa  818    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  52.55 
 
 
695 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  52.56 
 
 
691 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  51.3 
 
 
694 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.74 
 
 
668 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  52.56 
 
 
691 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1838  transketolase  63.49 
 
 
758 aa  883    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000877092 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  48.5 
 
 
666 aa  646    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.19 
 
 
666 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  53.94 
 
 
698 aa  715    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52.15 
 
 
697 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4785  transketolase  63.49 
 
 
719 aa  835    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  49.7 
 
 
668 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  53.29 
 
 
691 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  49.64 
 
 
694 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2414  transketolase  61.83 
 
 
697 aa  818    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.46 
 
 
667 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  52.48 
 
 
691 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0902  transketolase  52.37 
 
 
699 aa  722    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  53.03 
 
 
688 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  63.84 
 
 
699 aa  903    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.8 
 
 
671 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  48.95 
 
 
666 aa  655    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  64.11 
 
 
725 aa  901    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.8 
 
 
668 aa  677    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2161  transketolase  63.37 
 
 
721 aa  848    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  69.97 
 
 
712 aa  983    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11430  transketolase  58.13 
 
 
724 aa  762    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2097  transketolase  63 
 
 
708 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.718906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  53.2 
 
 
686 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  53.29 
 
 
691 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  51.68 
 
 
703 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1264  transketolase  61.46 
 
 
706 aa  873    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3692  transketolase  61.55 
 
 
697 aa  843    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658008  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  100 
 
 
692 aa  1404    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  62.66 
 
 
710 aa  872    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  49.17 
 
 
671 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  51.39 
 
 
687 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  64.39 
 
 
714 aa  879    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2460  transketolase  61.83 
 
 
697 aa  818    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  50.87 
 
 
711 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>