More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1838 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11430  transketolase  63.03 
 
 
724 aa  877    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  64.4 
 
 
741 aa  906    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2522  transketolase  64.14 
 
 
699 aa  848    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  61.37 
 
 
697 aa  889    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2246  transketolase  65.6 
 
 
708 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  68.78 
 
 
708 aa  984    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0442  transketolase  52.39 
 
 
702 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.369488  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0902  transketolase  54.55 
 
 
699 aa  757    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1934  transketolase  67.06 
 
 
722 aa  939    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  62.75 
 
 
710 aa  892    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2262  transketolase  63.77 
 
 
707 aa  868    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000167932  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4785  transketolase  64.04 
 
 
719 aa  862    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  51.5 
 
 
682 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3692  transketolase  63.18 
 
 
697 aa  864    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658008  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  61.82 
 
 
707 aa  890    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  63.57 
 
 
741 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  61.84 
 
 
700 aa  839    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  63.86 
 
 
712 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  63.53 
 
 
701 aa  924    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  64.25 
 
 
695 aa  941    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2414  transketolase  62.87 
 
 
697 aa  830    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1557  transketolase  66.13 
 
 
702 aa  897    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2374  transketolase  64.55 
 
 
695 aa  874    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15270  transketolase  62.43 
 
 
698 aa  879    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0942256  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2097  transketolase  89.25 
 
 
708 aa  1275    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.718906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2454  transketolase  62.87 
 
 
697 aa  830    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1838  transketolase  100 
 
 
758 aa  1540    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000877092 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  63.49 
 
 
692 aa  893    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1264  transketolase  70.04 
 
 
706 aa  1015    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  67.1 
 
 
723 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2161  transketolase  66.1 
 
 
721 aa  907    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  63.77 
 
 
714 aa  898    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  66.28 
 
 
697 aa  919    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2460  transketolase  62.87 
 
 
697 aa  830    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2720  transketolase  63.38 
 
 
697 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0703691  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  64.73 
 
 
697 aa  933    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  71.91 
 
 
725 aa  1035    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  64.89 
 
 
699 aa  908    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  48.92 
 
 
667 aa  631  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  48.25 
 
 
653 aa  622  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  47.25 
 
 
668 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  46.41 
 
 
668 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  47.44 
 
 
688 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  46.65 
 
 
697 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.23 
 
 
668 aa  608  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  48.41 
 
 
675 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  46.4 
 
 
676 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  47.32 
 
 
674 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  47.98 
 
 
672 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  46.4 
 
 
676 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  45.7 
 
 
711 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  48.99 
 
 
655 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  47.89 
 
 
678 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  44.8 
 
 
666 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  46.35 
 
 
664 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  48.78 
 
 
662 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  44.94 
 
 
666 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  48.91 
 
 
663 aa  591  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  44.8 
 
 
666 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  44.8 
 
 
666 aa  591  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  44.8 
 
 
680 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  46.16 
 
 
698 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  44.22 
 
 
666 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  45.7 
 
 
684 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  44.8 
 
 
666 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  44.65 
 
 
680 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  44.8 
 
 
666 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  47.61 
 
 
668 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  44.36 
 
 
666 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  44.97 
 
 
668 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  46.1 
 
 
669 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.04 
 
 
668 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  46.83 
 
 
668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  45.92 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  44.54 
 
 
668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  45.92 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.53 
 
 
665 aa  579  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  44.17 
 
 
668 aa  582  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  47.04 
 
 
670 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  47.25 
 
 
694 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  47.04 
 
 
670 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  45.53 
 
 
711 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  44.51 
 
 
666 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  45.53 
 
 
671 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  43.6 
 
 
668 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  45.9 
 
 
672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  46.4 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  47.04 
 
 
669 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  44.09 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  45.81 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  44.83 
 
 
681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  45.38 
 
 
670 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  46.6 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.61 
 
 
662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  47.03 
 
 
703 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  43.88 
 
 
670 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  43.74 
 
 
670 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  47.3 
 
 
691 aa  572  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  44.6 
 
 
707 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  45.49 
 
 
667 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>