More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2214 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.02 
 
 
666 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.16 
 
 
666 aa  639    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4785  transketolase  64.14 
 
 
719 aa  865    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1838  transketolase  68.78 
 
 
758 aa  976    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000877092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  54.56 
 
 
653 aa  684    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  68.86 
 
 
741 aa  949    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  47.87 
 
 
666 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  49.71 
 
 
698 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0442  transketolase  52.59 
 
 
702 aa  723    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.369488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.79 
 
 
711 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  100 
 
 
708 aa  1432    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.02 
 
 
666 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  77.59 
 
 
701 aa  1117    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.02 
 
 
666 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  72.07 
 
 
697 aa  1023    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.02 
 
 
666 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.02 
 
 
680 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  63.92 
 
 
700 aa  852    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.51 
 
 
668 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  68.8 
 
 
697 aa  969    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  74.96 
 
 
712 aa  1069    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  76.02 
 
 
707 aa  1080    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1934  transketolase  69.42 
 
 
722 aa  965    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2454  transketolase  61.54 
 
 
697 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  74.22 
 
 
741 aa  1054    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.49 
 
 
674 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.44 
 
 
672 aa  656    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  53.07 
 
 
662 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  68.79 
 
 
725 aa  976    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.02 
 
 
666 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  51.54 
 
 
668 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2246  transketolase  67.44 
 
 
708 aa  950    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  47.8 
 
 
707 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.6 
 
 
666 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  69.05 
 
 
697 aa  945    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.46 
 
 
680 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2522  transketolase  62.45 
 
 
699 aa  834    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2161  transketolase  67.59 
 
 
721 aa  915    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.09 
 
 
678 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  56.6 
 
 
682 aa  712    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1264  transketolase  67.24 
 
 
706 aa  965    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2262  transketolase  64.35 
 
 
707 aa  864    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000167932  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  69.04 
 
 
699 aa  955    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  51.54 
 
 
667 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11430  transketolase  63.58 
 
 
724 aa  861    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  49.85 
 
 
697 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  71.41 
 
 
695 aa  1026    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3692  transketolase  60.78 
 
 
697 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658008  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.06 
 
 
676 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.78 
 
 
691 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2414  transketolase  61.54 
 
 
697 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  51.59 
 
 
688 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  49.93 
 
 
711 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0902  transketolase  54.87 
 
 
699 aa  761    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.06 
 
 
676 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2097  transketolase  67.34 
 
 
708 aa  960    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.718906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  77.03 
 
 
723 aa  1114    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.78 
 
 
691 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2374  transketolase  64.21 
 
 
695 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  65.75 
 
 
710 aa  919    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  71.02 
 
 
692 aa  996    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.37 
 
 
668 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15270  transketolase  65.17 
 
 
698 aa  904    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0942256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1557  transketolase  64.94 
 
 
702 aa  870    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  64.1 
 
 
714 aa  893    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.63 
 
 
668 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2460  transketolase  61.54 
 
 
697 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.58 
 
 
666 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2720  transketolase  61.22 
 
 
697 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0703691  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.36 
 
 
691 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  50.71 
 
 
686 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  51.1 
 
 
664 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.32 
 
 
684 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  50.07 
 
 
681 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  49.71 
 
 
672 aa  632  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.22 
 
 
665 aa  633  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.32 
 
 
675 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  50 
 
 
668 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.66 
 
 
669 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  48.75 
 
 
670 aa  631  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  47.73 
 
 
668 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  50.22 
 
 
670 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  50.22 
 
 
670 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  48.47 
 
 
669 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  47.81 
 
 
668 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  47.74 
 
 
669 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  48.1 
 
 
668 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  47.95 
 
 
668 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.44 
 
 
671 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  53 
 
 
655 aa  625  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  46.71 
 
 
666 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.35 
 
 
666 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.35 
 
 
666 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  53.04 
 
 
663 aa  621  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  46.72 
 
 
670 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  48.47 
 
 
670 aa  621  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  48.83 
 
 
669 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  47.29 
 
 
664 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  46.58 
 
 
670 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  49.71 
 
 
695 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>