More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2541 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2922  transketolase  66.81 
 
 		 697 aa  943    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2262  transketolase  64.93 
 
 		 707 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000167932  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  63.54 
 
 		 700 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  65.71 
 
 		 697 aa  914    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  62.39 
 
 		 710 aa  867    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2161  transketolase  63.77 
 
 		 721 aa  875    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  63.71 
 
 		 708 aa  900    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0442  transketolase  51.5 
 
 		 702 aa  710    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.369488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  50.73 
 
 		 674 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  49.42 
 
 		 668 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.04 
 
 		 668 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  63.78 
 
 		 707 aa  907    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1838  transketolase  63.81 
 
 		 758 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000877092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  67.77 
 
 		 741 aa  938    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  67.96 
 
 		 695 aa  949    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1934  transketolase  69.26 
 
 		 722 aa  942    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  63.34 
 
 		 712 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1557  transketolase  62.17 
 
 		 702 aa  845    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  50.94 
 
 		 678 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11430  transketolase  59.37 
 
 		 724 aa  817    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  63.41 
 
 		 701 aa  910    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  64.08 
 
 		 699 aa  911    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  48.4 
 
 		 697 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2454  transketolase  63.08 
 
 		 697 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2414  transketolase  63.08 
 
 		 697 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15270  transketolase  61.73 
 
 		 698 aa  862    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0942256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1264  transketolase  63.14 
 
 		 706 aa  903    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2374  transketolase  64.7 
 
 		 695 aa  856    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2522  transketolase  63.13 
 
 		 699 aa  831    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  67.1 
 
 		 723 aa  935    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  64.81 
 
 		 725 aa  929    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4785  transketolase  64.58 
 
 		 719 aa  859    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3692  transketolase  61.91 
 
 		 697 aa  841    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  67.04 
 
 		 697 aa  913    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2097  transketolase  65.01 
 
 		 708 aa  907    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.718906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2246  transketolase  64.02 
 
 		 708 aa  864    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  63.86 
 
 		 692 aa  881    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0902  transketolase  53.35 
 
 		 699 aa  733    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  100 
 
 		 714 aa  1448    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  64.61 
 
 		 741 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2460  transketolase  63.08 
 
 		 697 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2720  transketolase  63.29 
 
 		 697 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0703691  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  49.64 
 
 		 667 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  48 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  48 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  46.81 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  46.81 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  50.29 
 
 		 686 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  46.52 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  46.81 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  48.43 
 
 		 687 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  46.38 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  46.81 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  46.81 
 
 		 680 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.34 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  49.01 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  49.64 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  49.34 
 
 		 682 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  47.16 
 
 		 694 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  49.64 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  48.5 
 
 		 695 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  47.32 
 
 		 694 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  47.68 
 
 		 676 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  51.37 
 
 		 662 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  47.68 
 
 		 676 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.3 
 
 		 668 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  48.86 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  45.95 
 
 		 664 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  47.94 
 
 		 703 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  47.45 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  48.92 
 
 		 688 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  47.18 
 
 		 698 aa  609  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  45.95 
 
 		 664 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  45.66 
 
 		 664 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  48.29 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  45.95 
 
 		 664 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  46.52 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  45.81 
 
 		 664 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  48.63 
 
 		 653 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  47.35 
 
 		 711 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.44 
 
 		 668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  45.95 
 
 		 664 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  45.16 
 
 		 674 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  45.16 
 
 		 674 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  45.97 
 
 		 707 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  47.98 
 
 		 672 aa  598  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  45.6 
 
 		 664 aa  598  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  46.99 
 
 		 671 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  46.53 
 
 		 684 aa  595  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  46.09 
 
 		 666 aa  588  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  46.16 
 
 		 711 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  47.91 
 
 		 675 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.82 
 
 		 665 aa  586  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  46.15 
 
 		 666 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  45.43 
 
 		 666 aa  581  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  45.43 
 
 		 666 aa  581  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  45.2 
 
 		 681 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  45.53 
 
 		 672 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>