More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5017 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  51.25 
 
 		 711 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.98 
 
 		 680 aa  660    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  50.89 
 
 		 676 aa  658    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  100 
 
 		 691 aa  1414    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50 
 
 		 666 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50 
 
 		 666 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.91 
 
 		 711 aa  680    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.25 
 
 		 666 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  49.12 
 
 		 680 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.47 
 
 		 672 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  97.97 
 
 		 691 aa  1367    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.55 
 
 		 666 aa  660    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  51.45 
 
 		 691 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.97 
 
 		 667 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53.25 
 
 		 682 aa  702    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  50.07 
 
 		 741 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  63.14 
 
 		 694 aa  875    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  51.94 
 
 		 681 aa  690    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  51.19 
 
 		 664 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  48.98 
 
 		 684 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  62.74 
 
 		 686 aa  870    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  86.25 
 
 		 691 aa  1244    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  48.72 
 
 		 697 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  50.45 
 
 		 668 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  55.67 
 
 		 707 aa  793    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  51.82 
 
 		 688 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  49.25 
 
 		 666 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  51.9 
 
 		 678 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  666    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  49.48 
 
 		 671 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50 
 
 		 669 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  48.81 
 
 		 666 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  63.03 
 
 		 694 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  80.23 
 
 		 687 aa  1145    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  50.89 
 
 		 676 aa  658    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  51.26 
 
 		 668 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  50.67 
 
 		 668 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  61.54 
 
 		 697 aa  862    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  51.91 
 
 		 691 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  50.22 
 
 		 668 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  50.44 
 
 		 672 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  64.96 
 
 		 698 aa  934    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  50.74 
 
 		 674 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  51.47 
 
 		 662 aa  640    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  51.3 
 
 		 699 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  51.91 
 
 		 691 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  649    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  52.48 
 
 		 692 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  62.68 
 
 		 703 aa  870    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  78.99 
 
 		 695 aa  1129    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  97.97 
 
 		 691 aa  1367    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  49.55 
 
 		 666 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.6 
 
 		 675 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  48.51 
 
 		 707 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  49.03 
 
 		 670 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  48.51 
 
 		 701 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  48.98 
 
 		 695 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  49.64 
 
 		 723 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.22 
 
 		 712 aa  628  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  48.44 
 
 		 671 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  50.37 
 
 		 697 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  50.07 
 
 		 708 aa  621  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.79 
 
 		 665 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  48.3 
 
 		 741 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.19 
 
 		 667 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  47.77 
 
 		 670 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  45.12 
 
 		 670 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  46.73 
 
 		 669 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  45.75 
 
 		 668 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  48.22 
 
 		 670 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  45.45 
 
 		 668 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  47.63 
 
 		 695 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  47.87 
 
 		 697 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  48.22 
 
 		 670 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  48.98 
 
 		 714 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  48.01 
 
 		 725 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  45.31 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  45.31 
 
 		 668 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  46.05 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  45.12 
 
 		 670 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  46.19 
 
 		 664 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  46.34 
 
 		 664 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  46.34 
 
 		 664 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  46.19 
 
 		 664 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  46.19 
 
 		 664 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  46.19 
 
 		 664 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.36 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  46.43 
 
 		 669 aa  601  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  46.97 
 
 		 710 aa  602  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  46.04 
 
 		 664 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  46.28 
 
 		 669 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  46.19 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  48.87 
 
 		 653 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  46.19 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>