More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3879 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1904  transketolase  49.93 
 
 		 668 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.12 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.12 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  51.53 
 
 		 691 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.77 
 
 		 666 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.77 
 
 		 666 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  54.72 
 
 		 670 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.8 
 
 		 664 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.97 
 
 		 680 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.3 
 
 		 662 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.97 
 
 		 670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.97 
 
 		 670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  54.14 
 
 		 664 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  56.01 
 
 		 666 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.49 
 
 		 669 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  55.22 
 
 		 661 aa  694    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  51.88 
 
 		 712 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  53.19 
 
 		 674 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  56.31 
 
 		 666 aa  769    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  54.14 
 
 		 664 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  56.16 
 
 		 666 aa  766    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  53.89 
 
 		 664 aa  714    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  56.16 
 
 		 666 aa  767    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  51.34 
 
 		 670 aa  694    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  57.31 
 
 		 711 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  54.86 
 
 		 676 aa  735    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  51.87 
 
 		 660 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  51.45 
 
 		 665 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.12 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.19 
 
 		 670 aa  695    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50 
 
 		 668 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  51.98 
 
 		 695 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.5 
 
 		 670 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.8 
 
 		 669 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  52.12 
 
 		 703 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  51.84 
 
 		 691 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.47 
 
 		 664 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  53.03 
 
 		 665 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.55 
 
 		 684 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.22 
 
 		 669 aa  678    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  53.15 
 
 		 669 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.12 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.82 
 
 		 694 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  53.19 
 
 		 674 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  56.31 
 
 		 666 aa  769    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.93 
 
 		 668 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.89 
 
 		 668 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  54.14 
 
 		 664 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  49.79 
 
 		 707 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  52.47 
 
 		 665 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  51.44 
 
 		 662 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.12 
 
 		 667 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.97 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  49.64 
 
 		 694 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  56.99 
 
 		 667 aa  745    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.8 
 
 		 664 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  52.49 
 
 		 686 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  52.55 
 
 		 679 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  51.65 
 
 		 664 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  50.82 
 
 		 665 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  56.31 
 
 		 666 aa  760    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  51.09 
 
 		 691 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.14 
 
 		 697 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  55.14 
 
 		 667 aa  699    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.93 
 
 		 668 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  56.07 
 
 		 691 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.78 
 
 		 668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  55.93 
 
 		 691 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.7 
 
 		 662 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.51 
 
 		 672 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  51.27 
 
 		 668 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  54.14 
 
 		 664 aa  714    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  51.44 
 
 		 662 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.35 
 
 		 723 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  60.24 
 
 		 678 aa  777    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.67 
 
 		 663 aa  636    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.35 
 
 		 663 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  51.35 
 
 		 665 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  52.87 
 
 		 658 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  52.87 
 
 		 679 aa  674    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  52.47 
 
 		 658 aa  658    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  61.19 
 
 		 674 aa  788    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  51.59 
 
 		 741 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  56.07 
 
 		 691 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  53.97 
 
 		 655 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.07 
 
 		 663 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  52.43 
 
 		 692 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  51.97 
 
 		 695 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.91 
 
 		 671 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  56.65 
 
 		 666 aa  775    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  51.41 
 
 		 698 aa  673    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.26 
 
 		 671 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  56.16 
 
 		 666 aa  767    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  50.94 
 
 		 694 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  52.47 
 
 		 665 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.69 
 
 		 666 aa  709    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  55.07 
 
 		 688 aa  732    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  56.61 
 
 		 666 aa  771    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>