More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2804 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  52.74 
 
 		 682 aa  662    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  51.06 
 
 		 661 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.44 
 
 		 666 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.44 
 
 		 666 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  61.33 
 
 		 668 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50.59 
 
 		 688 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  100 
 
 		 665 aa  1359    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  53.35 
 
 		 665 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  52.98 
 
 		 666 aa  685    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  63.84 
 
 		 679 aa  877    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.66 
 
 		 667 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  63.75 
 
 		 668 aa  816    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  52.82 
 
 		 665 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  52.74 
 
 		 665 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  52.9 
 
 		 665 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.5 
 
 		 672 aa  639    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  51.45 
 
 		 660 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  72.14 
 
 		 668 aa  972    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.98 
 
 		 666 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  49.47 
 
 		 671 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.46 
 
 		 668 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  48.02 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.45 
 
 		 675 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  49.54 
 
 		 666 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  48.93 
 
 		 697 aa  625  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.63 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  49.1 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.63 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.63 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.33 
 
 		 691 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.48 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.33 
 
 		 691 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.63 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.48 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.63 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  49.18 
 
 		 670 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.3 
 
 		 669 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.48 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  49.92 
 
 		 670 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  49.92 
 
 		 670 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  50.37 
 
 		 699 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  51.53 
 
 		 678 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.17 
 
 		 666 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  49.63 
 
 		 668 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  50.67 
 
 		 667 aa  615  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.47 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  47.92 
 
 		 711 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  47.62 
 
 		 711 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.32 
 
 		 676 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.32 
 
 		 676 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.69 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.48 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  49.12 
 
 		 691 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  50 
 
 		 668 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.79 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  48.43 
 
 		 708 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  48.72 
 
 		 664 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  48.8 
 
 		 723 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.61 
 
 		 723 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  49.85 
 
 		 663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  47.13 
 
 		 670 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  48.1 
 
 		 661 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  48.81 
 
 		 686 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  49.23 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  49.85 
 
 		 665 aa  602  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  47.43 
 
 		 670 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  48.31 
 
 		 666 aa  601  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  50.15 
 
 		 674 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  47.84 
 
 		 663 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.69 
 
 		 665 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  50.83 
 
 		 655 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.54 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  47.01 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  48.04 
 
 		 669 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  48.9 
 
 		 690 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  48.82 
 
 		 698 aa  598  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  48.54 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  49.16 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.85 
 
 		 665 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  47.68 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  48.1 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  47.69 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  46.97 
 
 		 668 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  47.83 
 
 		 686 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  48.76 
 
 		 693 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  48.38 
 
 		 674 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  47.38 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  48.58 
 
 		 672 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  47.61 
 
 		 663 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  49.04 
 
 		 680 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  48.73 
 
 		 660 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  49.04 
 
 		 699 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  47.84 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>