More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0841 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0644  transketolase  54.73 
 
 		 666 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.73 
 
 		 666 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  70.66 
 
 		 668 aa  955    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  54.22 
 
 		 672 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  54.52 
 
 		 682 aa  668    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  51.61 
 
 		 660 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  54.66 
 
 		 665 aa  675    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  51.45 
 
 		 661 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  100 
 
 		 679 aa  1384    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  63.84 
 
 		 665 aa  860    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  52.18 
 
 		 664 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  53.86 
 
 		 678 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  70.81 
 
 		 668 aa  952    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  54.96 
 
 		 665 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  55.06 
 
 		 666 aa  697    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  54.6 
 
 		 666 aa  692    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  54.57 
 
 		 665 aa  697    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  49.54 
 
 		 671 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.65 
 
 		 674 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.31 
 
 		 667 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  54.35 
 
 		 665 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  65.72 
 
 		 668 aa  891    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50.89 
 
 		 688 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.79 
 
 		 711 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  51.65 
 
 		 711 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  52.53 
 
 		 670 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.38 
 
 		 668 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.55 
 
 		 675 aa  628  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  51.06 
 
 		 653 aa  627  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.73 
 
 		 668 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  49.1 
 
 		 665 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  47.53 
 
 		 680 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.79 
 
 		 668 aa  625  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.38 
 
 		 673 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  50.75 
 
 		 671 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.46 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.35 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  48.87 
 
 		 668 aa  621  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  48.87 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50.3 
 
 		 671 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.98 
 
 		 655 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  50 
 
 		 671 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  50.45 
 
 		 699 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  47.53 
 
 		 666 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  48.93 
 
 		 666 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  49.31 
 
 		 671 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  47.39 
 
 		 662 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  48.93 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.93 
 
 		 684 aa  612  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  49.7 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  50.99 
 
 		 681 aa  608  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.78 
 
 		 723 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.47 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  48.47 
 
 		 668 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  49.17 
 
 		 666 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  49.69 
 
 		 684 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  51.28 
 
 		 655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  48.68 
 
 		 686 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.93 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.93 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.47 
 
 		 692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  50.84 
 
 		 663 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  47.42 
 
 		 666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  50.84 
 
 		 665 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  47.43 
 
 		 657 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.32 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  51.35 
 
 		 663 aa  601  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  50.53 
 
 		 680 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  47.87 
 
 		 668 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.05 
 
 		 665 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  49.01 
 
 		 664 aa  598  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  49.03 
 
 		 668 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  49.54 
 
 		 668 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  49.63 
 
 		 668 aa  596  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  47.81 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  48.58 
 
 		 698 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  47.21 
 
 		 665 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.93 
 
 		 712 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  47.81 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  49.93 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  46.67 
 
 		 673 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.28 
 
 		 666 aa  595  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  48.95 
 
 		 669 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  49.03 
 
 		 682 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  47.81 
 
 		 671 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.87 
 
 		 664 aa  594  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  48.58 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  48.58 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.36 
 
 		 694 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.24 
 
 		 667 aa  589  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  46.94 
 
 		 666 aa  590  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1981  transketolase  46.98 
 
 		 664 aa  592  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  48.08 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  46.49 
 
 		 681 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>