More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3423 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14410  transketolase  51.46 
 
 		 660 aa  665    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  56.69 
 
 		 665 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.62 
 
 		 666 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.62 
 
 		 666 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  100 
 
 		 668 aa  1338    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.58 
 
 		 666 aa  680    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  56.42 
 
 		 665 aa  679    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  53.31 
 
 		 653 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  51.36 
 
 		 665 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.7 
 
 		 667 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  52.42 
 
 		 666 aa  673    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.68 
 
 		 672 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  55 
 
 		 665 aa  688    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  70.66 
 
 		 679 aa  978    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.48 
 
 		 664 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  83.83 
 
 		 668 aa  1123    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  53.73 
 
 		 678 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  57.19 
 
 		 665 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  52.49 
 
 		 688 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  51.45 
 
 		 661 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  63.77 
 
 		 668 aa  848    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  54.21 
 
 		 682 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  61.33 
 
 		 665 aa  801    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  49.54 
 
 		 671 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.71 
 
 		 674 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.99 
 
 		 668 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.49 
 
 		 668 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  52.53 
 
 		 711 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  52.99 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.77 
 
 		 675 aa  628  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  52.99 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.13 
 
 		 680 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  48.93 
 
 		 668 aa  621  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.34 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.49 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.98 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.11 
 
 		 668 aa  621  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.64 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.49 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.34 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.34 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  52.08 
 
 		 711 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.49 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  50.52 
 
 		 699 aa  618  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  52.95 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  52.38 
 
 		 670 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  51.04 
 
 		 708 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.47 
 
 		 684 aa  608  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  49.62 
 
 		 681 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  51.92 
 
 		 671 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  51.41 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  50.15 
 
 		 667 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.19 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.27 
 
 		 655 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  48.17 
 
 		 666 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  51.82 
 
 		 655 aa  604  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  51.35 
 
 		 663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  49.7 
 
 		 673 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  51.49 
 
 		 680 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  46.6 
 
 		 662 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  47.05 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  47.05 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.34 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  50.3 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  50.07 
 
 		 741 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  46.21 
 
 		 663 aa  600  1e-170  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  49.48 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  47.83 
 
 		 697 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  50.22 
 
 		 712 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50.84 
 
 		 671 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  50.38 
 
 		 660 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  48.77 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  50.15 
 
 		 701 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.08 
 
 		 662 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  50.61 
 
 		 671 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  46.74 
 
 		 665 aa  589  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  46.27 
 
 		 661 aa  589  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  48.42 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  48.74 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  49.85 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  47.62 
 
 		 671 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  47.62 
 
 		 671 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  46.52 
 
 		 657 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  45.88 
 
 		 668 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  45.81 
 
 		 668 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  49.26 
 
 		 707 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  46.89 
 
 		 677 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.85 
 
 		 676 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  47.92 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  48.96 
 
 		 665 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.85 
 
 		 676 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  45.07 
 
 		 666 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  46.47 
 
 		 673 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.13 
 
 		 664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  47.88 
 
 		 707 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  49.48 
 
 		 723 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  47.13 
 
 		 664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1981  transketolase  46.77 
 
 		 664 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>