More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03290 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0131  transketolase  49.7 
 
 
666 aa  635    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  49.69 
 
 
666 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  49.69 
 
 
666 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  51.45 
 
 
668 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  49.39 
 
 
666 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  53.02 
 
 
675 aa  686    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  48.2 
 
 
711 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.39 
 
 
666 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.31 
 
 
666 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.02 
 
 
668 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  100 
 
 
661 aa  1350    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.69 
 
 
666 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.39 
 
 
666 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.39 
 
 
666 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  49.54 
 
 
666 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53 
 
 
682 aa  686    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  50 
 
 
666 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  50.83 
 
 
665 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  50.84 
 
 
668 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  48.4 
 
 
662 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.69 
 
 
666 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.78 
 
 
671 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  51 
 
 
668 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  51.84 
 
 
668 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.06 
 
 
672 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  49.85 
 
 
666 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  50 
 
 
678 aa  651    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  50.38 
 
 
668 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  51.45 
 
 
679 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  48.93 
 
 
666 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  98.93 
 
 
660 aa  1327    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  51.06 
 
 
665 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.15 
 
 
665 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  48.94 
 
 
674 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.08 
 
 
668 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  49.23 
 
 
680 aa  674    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  50.3 
 
 
666 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  48.41 
 
 
660 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  48.35 
 
 
711 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  49.54 
 
 
680 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  49.39 
 
 
667 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  50.38 
 
 
675 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  48.94 
 
 
670 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  48.17 
 
 
676 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  50.15 
 
 
653 aa  630  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  48.17 
 
 
676 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.78 
 
 
662 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  49.54 
 
 
668 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  49.7 
 
 
667 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  49.7 
 
 
667 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  48.94 
 
 
670 aa  628  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  47.65 
 
 
663 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  49.39 
 
 
664 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  49.17 
 
 
662 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  49.09 
 
 
662 aa  625  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  49.7 
 
 
667 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  49.7 
 
 
667 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  49.55 
 
 
667 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  49.54 
 
 
663 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.7 
 
 
663 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.49 
 
 
663 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  49.7 
 
 
667 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  49.7 
 
 
667 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.87 
 
 
664 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  49.55 
 
 
667 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  49.31 
 
 
664 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  47.46 
 
 
688 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.49 
 
 
665 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  48.65 
 
 
691 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.39 
 
 
664 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  48.65 
 
 
691 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  48.77 
 
 
664 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  48.77 
 
 
664 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49 
 
 
664 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  48.77 
 
 
664 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  47.81 
 
 
668 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  47.36 
 
 
668 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  49.16 
 
 
663 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  49.09 
 
 
665 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  48.63 
 
 
663 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  49.24 
 
 
671 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  48.48 
 
 
663 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  48.48 
 
 
663 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  49.69 
 
 
664 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  48.48 
 
 
663 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.86 
 
 
680 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  47.42 
 
 
675 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  47.87 
 
 
663 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  47.89 
 
 
662 aa  617  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  47.56 
 
 
664 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.56 
 
 
664 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.87 
 
 
664 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  48.7 
 
 
666 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  48.47 
 
 
666 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>