More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1241 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  48.48 
 
 		 667 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.45 
 
 		 663 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.45 
 
 		 663 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  48.48 
 
 		 667 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.5 
 
 		 666 aa  723    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.5 
 
 		 666 aa  723    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  52.2 
 
 		 666 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.29 
 
 		 665 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  51.1 
 
 		 675 aa  665    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  60.36 
 
 		 662 aa  839    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.3 
 
 		 670 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.3 
 
 		 670 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  61.17 
 
 		 664 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  73.27 
 
 		 666 aa  1050    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  49.85 
 
 		 662 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  62.29 
 
 		 661 aa  824    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  49.78 
 
 		 675 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  50.23 
 
 		 664 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  60.41 
 
 		 674 aa  820    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  73.42 
 
 		 666 aa  1047    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  61.47 
 
 		 664 aa  832    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  73.12 
 
 		 666 aa  1045    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  49.7 
 
 		 655 aa  649    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  61.17 
 
 		 664 aa  827    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  73.42 
 
 		 666 aa  1048    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  49.78 
 
 		 690 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  47.6 
 
 		 668 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  47.9 
 
 		 668 aa  663    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  54.04 
 
 		 668 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.23 
 
 		 665 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  48.26 
 
 		 665 aa  643    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  50.45 
 
 		 668 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  50.22 
 
 		 690 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50 
 
 		 707 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  53.79 
 
 		 670 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  50.83 
 
 		 668 aa  651    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.08 
 
 		 661 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  56.7 
 
 		 670 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  49.93 
 
 		 690 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  49.01 
 
 		 665 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  50.08 
 
 		 681 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.33 
 
 		 664 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  49.85 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  54.3 
 
 		 684 aa  753    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  56.05 
 
 		 669 aa  755    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  55.75 
 
 		 669 aa  761    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  50.99 
 
 		 664 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50.07 
 
 		 696 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  60.41 
 
 		 674 aa  820    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  73.42 
 
 		 666 aa  1047    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  54.04 
 
 		 668 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  56.65 
 
 		 668 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  48.87 
 
 		 671 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  50.87 
 
 		 707 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  50.6 
 
 		 656 aa  653    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  54.34 
 
 		 668 aa  748    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  54.04 
 
 		 668 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  54.33 
 
 		 669 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  51.28 
 
 		 679 aa  672    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  50.22 
 
 		 664 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  50.3 
 
 		 667 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  50.52 
 
 		 663 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  50.08 
 
 		 664 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  54.38 
 
 		 670 aa  760    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  49.93 
 
 		 690 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  50.07 
 
 		 694 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  48.86 
 
 		 664 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  55.87 
 
 		 688 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  49.78 
 
 		 690 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  49.16 
 
 		 663 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  48.71 
 
 		 665 aa  644    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  49.78 
 
 		 690 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  50.38 
 
 		 665 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.17 
 
 		 697 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  57.44 
 
 		 667 aa  757    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  49.78 
 
 		 690 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  55.6 
 
 		 691 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  48.71 
 
 		 666 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  51.66 
 
 		 662 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  57.72 
 
 		 672 aa  762    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.75 
 
 		 664 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.59 
 
 		 664 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50 
 
 		 665 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  47.8 
 
 		 680 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  49.93 
 
 		 690 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  58.11 
 
 		 658 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  50.83 
 
 		 679 aa  693    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  58.97 
 
 		 658 aa  769    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  51.67 
 
 		 664 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  49.78 
 
 		 690 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  55.6 
 
 		 691 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  55.32 
 
 		 655 aa  716    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  51.44 
 
 		 664 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.33 
 
 		 692 aa  692    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  49.78 
 
 		 667 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.13 
 
 		 671 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  48.53 
 
 		 714 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>