More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl349 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.47 
 
 
668 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  48.51 
 
 
666 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.71 
 
 
666 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  100 
 
 
655 aa  1347    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.86 
 
 
680 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  49.47 
 
 
668 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  65.5 
 
 
656 aa  904    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  52.97 
 
 
662 aa  671    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  49.32 
 
 
666 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.86 
 
 
666 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.86 
 
 
680 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  50 
 
 
659 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  50.15 
 
 
659 aa  643    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  48.27 
 
 
662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  48.27 
 
 
662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.66 
 
 
665 aa  598  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  48.46 
 
 
658 aa  601  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  48.4 
 
 
658 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  47.09 
 
 
661 aa  598  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  47.58 
 
 
668 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  46.61 
 
 
662 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  45.34 
 
 
667 aa  592  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  47.05 
 
 
664 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  47.2 
 
 
664 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  47.2 
 
 
664 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  47.05 
 
 
664 aa  588  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  47.2 
 
 
664 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  46.9 
 
 
664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  45.33 
 
 
666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  47.5 
 
 
662 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  45.48 
 
 
666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  46.35 
 
 
674 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  46.35 
 
 
674 aa  581  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  46.6 
 
 
664 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.65 
 
 
666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.65 
 
 
666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  43.66 
 
 
684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  46.12 
 
 
668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.63 
 
 
668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  45.07 
 
 
669 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  45.93 
 
 
671 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  44.83 
 
 
668 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  44.53 
 
 
668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  45.57 
 
 
679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  44.38 
 
 
668 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  43.22 
 
 
711 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  42.77 
 
 
653 aa  567  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  43.26 
 
 
691 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  43.15 
 
 
688 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  44.61 
 
 
669 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  43.92 
 
 
668 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  43.26 
 
 
691 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  43.01 
 
 
670 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  43.31 
 
 
670 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  42.21 
 
 
711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  45.03 
 
 
681 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  44.07 
 
 
668 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  43.75 
 
 
678 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  45.5 
 
 
670 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  44.31 
 
 
660 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  44.22 
 
 
669 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  43.77 
 
 
669 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  43.87 
 
 
671 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  43.83 
 
 
675 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  45.18 
 
 
665 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  44.48 
 
 
672 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  43.4 
 
 
672 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  44.68 
 
 
664 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  43.72 
 
 
697 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  43.47 
 
 
691 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  42.36 
 
 
682 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  42.97 
 
 
674 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  44.26 
 
 
655 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  45.15 
 
 
670 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  43.53 
 
 
657 aa  551  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  42.71 
 
 
669 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  42.73 
 
 
664 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  43.83 
 
 
690 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  43.85 
 
 
661 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  42.49 
 
 
663 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  42.49 
 
 
663 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  43.83 
 
 
690 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  42.49 
 
 
663 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  43.83 
 
 
690 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  42.34 
 
 
663 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  42.34 
 
 
663 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  44.46 
 
 
670 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  43.29 
 
 
671 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  43.29 
 
 
671 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  42.34 
 
 
663 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  43.67 
 
 
690 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  42.34 
 
 
663 aa  544  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  43.66 
 
 
666 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  42.34 
 
 
663 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  43.75 
 
 
666 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>