More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1547 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  61.39 
 
 
666 aa  848    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  61.24 
 
 
666 aa  855    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  55.98 
 
 
664 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  50.08 
 
 
679 aa  635    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.31 
 
 
666 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.31 
 
 
666 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.01 
 
 
664 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  50 
 
 
690 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  56.4 
 
 
662 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  49.01 
 
 
670 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  49.01 
 
 
670 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  50.31 
 
 
664 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  53.33 
 
 
668 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  55.67 
 
 
664 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  61.09 
 
 
666 aa  853    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  47.9 
 
 
662 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  56.99 
 
 
661 aa  754    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  53.25 
 
 
660 aa  688    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.38 
 
 
668 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  55.29 
 
 
674 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  61.54 
 
 
666 aa  857    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  56.13 
 
 
664 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  61.39 
 
 
666 aa  858    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  50.38 
 
 
655 aa  642    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  55.82 
 
 
664 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  61.24 
 
 
666 aa  855    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  50 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  50.45 
 
 
667 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  49.04 
 
 
691 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  49.7 
 
 
671 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  48.86 
 
 
663 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.58 
 
 
694 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  61.09 
 
 
666 aa  850    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  50 
 
 
675 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  53.09 
 
 
670 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  51.29 
 
 
674 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.91 
 
 
661 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  54.68 
 
 
670 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  50 
 
 
690 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.01 
 
 
664 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  56.13 
 
 
664 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  58.93 
 
 
662 aa  776    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  50.07 
 
 
690 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.55 
 
 
684 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.03 
 
 
669 aa  690    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  53.25 
 
 
669 aa  704    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  56.28 
 
 
664 aa  734    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.8 
 
 
663 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  55.29 
 
 
674 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  61.54 
 
 
666 aa  857    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  53.48 
 
 
668 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  56.21 
 
 
668 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.63 
 
 
723 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  53.64 
 
 
668 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  61.09 
 
 
680 aa  854    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0976  transketolase  51.21 
 
 
664 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  48.96 
 
 
711 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  49.77 
 
 
664 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  49.77 
 
 
666 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  50 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  53.39 
 
 
670 aa  717    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  54.3 
 
 
670 aa  717    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  49.48 
 
 
688 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  50.91 
 
 
663 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.73 
 
 
680 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  48.26 
 
 
664 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  51.29 
 
 
662 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.73 
 
 
669 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  48.78 
 
 
666 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  55.3 
 
 
668 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  54.03 
 
 
669 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.55 
 
 
663 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  58.93 
 
 
662 aa  776    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50.15 
 
 
696 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  54.53 
 
 
670 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  48.72 
 
 
697 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.4 
 
 
667 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.68 
 
 
668 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  48.66 
 
 
691 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  47.05 
 
 
666 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.01 
 
 
662 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.92 
 
 
672 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  48.56 
 
 
664 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  53.33 
 
 
668 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  49.85 
 
 
666 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  51.6 
 
 
663 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  49.93 
 
 
690 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.63 
 
 
665 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  54.7 
 
 
658 aa  726    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  49.17 
 
 
679 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  66.46 
 
 
658 aa  911    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.01 
 
 
664 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  48.66 
 
 
691 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.75 
 
 
655 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  48.26 
 
 
664 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  50 
 
 
675 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  50 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  51.6 
 
 
665 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.05 
 
 
678 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>