More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0610 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl349  transketolase  65.58 
 
 		 655 aa  893    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  49.77 
 
 		 668 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  100 
 
 		 656 aa  1349    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  50.6 
 
 		 668 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  50.53 
 
 		 659 aa  633  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  51.06 
 
 		 662 aa  629  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  49.32 
 
 		 666 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  50.38 
 
 		 659 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.34 
 
 		 680 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.49 
 
 		 666 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.79 
 
 		 666 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.64 
 
 		 666 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.64 
 
 		 666 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.64 
 
 		 666 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.79 
 
 		 666 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.79 
 
 		 680 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  50.77 
 
 		 661 aa  622  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.34 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  50.68 
 
 		 658 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.23 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  48.63 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  48.63 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  46.27 
 
 		 667 aa  599  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.92 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.64 
 
 		 668 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  47.56 
 
 		 658 aa  587  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  44.53 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  44.53 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  47.13 
 
 		 662 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  43.95 
 
 		 688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  47.32 
 
 		 679 aa  574  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  42.73 
 
 		 711 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  44.48 
 
 		 678 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  44.36 
 
 		 684 aa  569  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  44.93 
 
 		 668 aa  569  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.28 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.28 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  45.93 
 
 		 660 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  46.63 
 
 		 681 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  42.62 
 
 		 711 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  45.29 
 
 		 657 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  44.51 
 
 		 663 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  44.36 
 
 		 663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  44.36 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  44.36 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  44.39 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  44.31 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  44.36 
 
 		 663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  44.36 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  44.97 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.28 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  44.97 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  44.36 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  44.31 
 
 		 663 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  44.36 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  44.31 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  44.97 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  44.85 
 
 		 663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  44.51 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  44.66 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  44.85 
 
 		 663 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  46.81 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  44.66 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  46.5 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  46.58 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  44.76 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  45.12 
 
 		 690 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  44.08 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  46.42 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  46.81 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  46.66 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  44.09 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  45.15 
 
 		 682 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  45.13 
 
 		 668 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  43.83 
 
 		 663 aa  558  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  46.12 
 
 		 664 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  46.49 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  43.46 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  46.12 
 
 		 670 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  44.66 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  44.78 
 
 		 664 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  43.46 
 
 		 664 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  44.46 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.28 
 
 		 666 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  43.46 
 
 		 664 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  45.29 
 
 		 680 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  44.66 
 
 		 690 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  44.06 
 
 		 694 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  44.38 
 
 		 663 aa  552  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  43.55 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  45.13 
 
 		 668 aa  555  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  44.97 
 
 		 690 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  44.25 
 
 		 680 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  45.25 
 
 		 664 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  44.97 
 
 		 690 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  43.46 
 
 		 664 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  43.66 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  43.07 
 
 		 672 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  45.25 
 
 		 664 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>