More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4511 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  54.56 
 
 
684 aa  702    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  52.65 
 
 
667 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  53.97 
 
 
663 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  53.97 
 
 
663 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  52.65 
 
 
667 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.79 
 
 
666 aa  742    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.79 
 
 
666 aa  742    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  53.18 
 
 
665 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  51.88 
 
 
662 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  55.41 
 
 
670 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  55.41 
 
 
670 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.42 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  50.45 
 
 
664 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  55.07 
 
 
666 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  50.97 
 
 
662 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  54.3 
 
 
661 aa  695    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  53.52 
 
 
664 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  52.12 
 
 
665 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.7 
 
 
674 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  54.78 
 
 
666 aa  738    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  50.6 
 
 
664 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54.78 
 
 
666 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  50.53 
 
 
664 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.78 
 
 
666 aa  737    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.42 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  50.76 
 
 
668 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  50 
 
 
668 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  54.76 
 
 
687 aa  718    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  52.12 
 
 
665 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  51.13 
 
 
665 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  54.07 
 
 
668 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  53.02 
 
 
690 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  52.09 
 
 
680 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  69.27 
 
 
670 aa  1006    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  51.71 
 
 
696 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  54.24 
 
 
661 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  77.94 
 
 
670 aa  1074    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.56 
 
 
690 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  51.36 
 
 
665 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.97 
 
 
681 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  54.19 
 
 
664 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  67.47 
 
 
668 aa  978    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.95 
 
 
684 aa  673    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  70.81 
 
 
669 aa  994    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  72.46 
 
 
669 aa  1025    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  54.09 
 
 
664 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  55.17 
 
 
666 aa  745    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.7 
 
 
674 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  54.78 
 
 
666 aa  738    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  67.02 
 
 
668 aa  973    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  78.71 
 
 
668 aa  1089    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  54.01 
 
 
671 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  52.93 
 
 
677 aa  672    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  55.34 
 
 
688 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.42 
 
 
690 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  52.34 
 
 
671 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  51.77 
 
 
655 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  69.72 
 
 
670 aa  1008    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.59 
 
 
667 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  62.82 
 
 
679 aa  862    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  54.12 
 
 
663 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  53.48 
 
 
664 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  76.15 
 
 
670 aa  1090    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  53.52 
 
 
662 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  52.92 
 
 
662 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  54.27 
 
 
664 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  52.47 
 
 
664 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  53.14 
 
 
663 aa  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  71.36 
 
 
669 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  54.41 
 
 
663 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.56 
 
 
690 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  67.32 
 
 
668 aa  978    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.42 
 
 
675 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  51.06 
 
 
665 aa  652    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.59 
 
 
697 aa  695    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.75 
 
 
667 aa  683    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  52.6 
 
 
668 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  54.72 
 
 
664 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  54.19 
 
 
691 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  51.82 
 
 
666 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  54.07 
 
 
662 aa  692    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  77.12 
 
 
672 aa  1059    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  54.12 
 
 
664 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  54.27 
 
 
664 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.33 
 
 
666 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.56 
 
 
665 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  52.99 
 
 
680 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  53.86 
 
 
680 aa  698    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  54.55 
 
 
665 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  52.26 
 
 
658 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.36 
 
 
658 aa  679    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  53.18 
 
 
666 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  54.19 
 
 
691 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  56.14 
 
 
655 aa  698    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  54.12 
 
 
664 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  50 
 
 
692 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  66.72 
 
 
668 aa  967    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  52.23 
 
 
671 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  52.39 
 
 
663 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  51.2 
 
 
667 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>