More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3415 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.87 
 
 		 666 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  49.56 
 
 		 667 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.77 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  49.56 
 
 		 667 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  49.63 
 
 		 666 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.12 
 
 		 666 aa  700    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.12 
 
 		 666 aa  700    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  49.41 
 
 		 667 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.96 
 
 		 669 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.7 
 
 		 671 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.45 
 
 		 662 aa  677    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  56.02 
 
 		 680 aa  763    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  55.35 
 
 		 664 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  52.62 
 
 		 670 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  54.9 
 
 		 664 aa  715    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  56.17 
 
 		 666 aa  766    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.18 
 
 		 664 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  55.15 
 
 		 661 aa  702    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  49.41 
 
 		 667 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  49.56 
 
 		 667 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  54.09 
 
 		 674 aa  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  56.33 
 
 		 666 aa  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  54.9 
 
 		 664 aa  715    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  56.17 
 
 		 666 aa  763    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.48 
 
 		 669 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  54.75 
 
 		 664 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  56.17 
 
 		 666 aa  763    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  49.63 
 
 		 666 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  50 
 
 		 703 aa  658    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.37 
 
 		 691 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  53.31 
 
 		 668 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  51.13 
 
 		 662 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.04 
 
 		 678 aa  693    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  49.26 
 
 		 698 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  52.55 
 
 		 668 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.87 
 
 		 670 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.08 
 
 		 663 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.18 
 
 		 664 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.84 
 
 		 670 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.92 
 
 		 676 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.11 
 
 		 667 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  48.81 
 
 		 711 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  50.6 
 
 		 684 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  52.93 
 
 		 669 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  53.38 
 
 		 669 aa  683    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  53.6 
 
 		 670 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.95 
 
 		 694 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  54.09 
 
 		 674 aa  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  56.33 
 
 		 666 aa  763    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  52.41 
 
 		 668 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.95 
 
 		 668 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  55.2 
 
 		 664 aa  718    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  46.95 
 
 		 707 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50.66 
 
 		 688 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.8 
 
 		 680 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  56.17 
 
 		 666 aa  763    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  59.15 
 
 		 660 aa  814    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  49.41 
 
 		 667 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  51.64 
 
 		 674 aa  699    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50 
 
 		 723 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  56.02 
 
 		 666 aa  750    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  52.32 
 
 		 668 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  56.02 
 
 		 666 aa  764    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  49.63 
 
 		 666 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  51.13 
 
 		 662 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  52.78 
 
 		 668 aa  680    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  49.19 
 
 		 695 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  55.2 
 
 		 664 aa  722    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52.18 
 
 		 697 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.26 
 
 		 667 aa  704    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.24 
 
 		 665 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  50.29 
 
 		 691 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.24 
 
 		 662 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  54.04 
 
 		 672 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  55.57 
 
 		 666 aa  754    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.18 
 
 		 664 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.86 
 
 		 670 aa  692    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  50.23 
 
 		 662 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.7 
 
 		 663 aa  658    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  51.96 
 
 		 668 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  49.48 
 
 		 666 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.38 
 
 		 665 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  53.74 
 
 		 658 aa  685    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  52.93 
 
 		 668 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  50.53 
 
 		 658 aa  646    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  49.63 
 
 		 666 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  50.29 
 
 		 691 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.87 
 
 		 655 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  49.56 
 
 		 667 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.55 
 
 		 663 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.92 
 
 		 676 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.22 
 
 		 671 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>