More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1308 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  51.1 
 
 		 668 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  100 
 
 		 675 aa  1383    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  52.82 
 
 		 660 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  49.41 
 
 		 680 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.68 
 
 		 666 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  49.27 
 
 		 680 aa  646    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  50.37 
 
 		 668 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  53.02 
 
 		 661 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  50.45 
 
 		 653 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  48.42 
 
 		 662 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  48.39 
 
 		 664 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  47.95 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  48.09 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  47.95 
 
 		 664 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  48.44 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  49.18 
 
 		 682 aa  609  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  47.65 
 
 		 664 aa  612  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  48.31 
 
 		 655 aa  609  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  47.95 
 
 		 664 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.98 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  48.73 
 
 		 663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  47.25 
 
 		 674 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  47.65 
 
 		 723 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  47.25 
 
 		 674 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.5 
 
 		 665 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  597  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  597  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.35 
 
 		 665 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.92 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.03 
 
 		 666 aa  595  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  47.44 
 
 		 666 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  46.94 
 
 		 672 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  46.67 
 
 		 678 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  47.08 
 
 		 675 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_002620  TC0131  transketolase  46.59 
 
 		 666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  47.25 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  46.84 
 
 		 667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  48.4 
 
 		 662 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  46.43 
 
 		 664 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  44.57 
 
 		 688 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  45.32 
 
 		 674 aa  582  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  46.93 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  46.21 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  45.91 
 
 		 668 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  47.53 
 
 		 665 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  49.26 
 
 		 659 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  45.92 
 
 		 691 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  47.49 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  45.92 
 
 		 691 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  46.73 
 
 		 665 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  46.07 
 
 		 670 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  46.07 
 
 		 670 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  45.19 
 
 		 662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  46.21 
 
 		 665 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  46.5 
 
 		 664 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  46.95 
 
 		 665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  45.37 
 
 		 684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  46.73 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  45.97 
 
 		 663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  46.5 
 
 		 662 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  46.28 
 
 		 666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  47.47 
 
 		 668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  49.11 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  46.59 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  46.44 
 
 		 664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  46.66 
 
 		 675 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  46.35 
 
 		 699 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  46.35 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  46.01 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.36 
 
 		 694 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  45.27 
 
 		 663 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  46.11 
 
 		 667 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  46.36 
 
 		 680 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  46.37 
 
 		 664 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  46.26 
 
 		 657 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  45.83 
 
 		 662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  46.05 
 
 		 664 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  46.28 
 
 		 661 aa  569  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3465  transketolase  45.78 
 
 		 664 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0633965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  46.18 
 
 		 664 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  46.17 
 
 		 667 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  45.36 
 
 		 662 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  46.07 
 
 		 664 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  46.04 
 
 		 665 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  45.41 
 
 		 691 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  45.69 
 
 		 711 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  45.36 
 
 		 662 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  45.6 
 
 		 660 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  45.87 
 
 		 680 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  46.6 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  46.73 
 
 		 665 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  45.13 
 
 		 663 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>