More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0178 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  55.76 
 
 		 665 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.28 
 
 		 666 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.28 
 
 		 666 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  83.83 
 
 		 668 aa  1120    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  51.29 
 
 		 666 aa  660    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  55.91 
 
 		 665 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  50.69 
 
 		 660 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  70.81 
 
 		 679 aa  979    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.6 
 
 		 664 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  54.17 
 
 		 665 aa  667    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  100 
 
 		 668 aa  1349    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  50.84 
 
 		 661 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  56.22 
 
 		 665 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.05 
 
 		 667 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.22 
 
 		 666 aa  659    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  54.32 
 
 		 682 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  65.57 
 
 		 668 aa  872    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  63.75 
 
 		 665 aa  829    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  54.08 
 
 		 678 aa  631  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.16 
 
 		 672 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  48.78 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.7 
 
 		 711 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  51.56 
 
 		 688 aa  628  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  47.84 
 
 		 668 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  49.85 
 
 		 668 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.64 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  47.88 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  47.73 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  47.88 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  47.88 
 
 		 666 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  47.88 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  47.88 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.88 
 
 		 666 aa  618  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.73 
 
 		 680 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  47.73 
 
 		 666 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  47.73 
 
 		 666 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  47.83 
 
 		 668 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  51.21 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.59 
 
 		 675 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  50.66 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  50.92 
 
 		 660 aa  611  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  50.66 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.87 
 
 		 711 aa  611  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.47 
 
 		 684 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  48.5 
 
 		 697 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  47.58 
 
 		 666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.75 
 
 		 668 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  48.18 
 
 		 666 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.22 
 
 		 673 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  51.66 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  48.94 
 
 		 664 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  48.25 
 
 		 665 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  48.86 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  50.22 
 
 		 708 aa  598  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.93 
 
 		 676 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  48.57 
 
 		 657 aa  598  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  50.6 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  49.1 
 
 		 699 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.67 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  49.77 
 
 		 681 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  48.22 
 
 		 671 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.93 
 
 		 676 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  47.88 
 
 		 667 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  50.6 
 
 		 692 aa  596  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  47.58 
 
 		 662 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  47.73 
 
 		 667 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  50.45 
 
 		 655 aa  593  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  51.27 
 
 		 680 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  47.95 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  46.61 
 
 		 662 aa  593  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  47.88 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  48.22 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  49.32 
 
 		 668 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  51.6 
 
 		 670 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  49.85 
 
 		 655 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  46.48 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  50.3 
 
 		 663 aa  590  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.29 
 
 		 664 aa  591  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  48.37 
 
 		 677 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  48.68 
 
 		 707 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  45.9 
 
 		 663 aa  588  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  46.48 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.5 
 
 		 665 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  46.83 
 
 		 663 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  46.83 
 
 		 663 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  50.07 
 
 		 686 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  47.42 
 
 		 666 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  47.5 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  47.07 
 
 		 664 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  46.83 
 
 		 663 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  47.42 
 
 		 666 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  46.28 
 
 		 666 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.07 
 
 		 664 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>