More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2601 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  54.49 
 
 		 682 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  50.61 
 
 		 666 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.42 
 
 		 666 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.42 
 
 		 666 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  63.77 
 
 		 668 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  51.91 
 
 		 660 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.21 
 
 		 665 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  72.14 
 
 		 665 aa  976    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  55.57 
 
 		 665 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  51.84 
 
 		 661 aa  678    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  54.27 
 
 		 666 aa  710    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  50.67 
 
 		 711 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  65.57 
 
 		 668 aa  867    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50.22 
 
 		 688 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  49.55 
 
 		 668 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  65.72 
 
 		 679 aa  913    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  55.42 
 
 		 665 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.51 
 
 		 668 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.2 
 
 		 667 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  51.75 
 
 		 653 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  54.14 
 
 		 672 aa  680    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  53.96 
 
 		 666 aa  705    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.28 
 
 		 697 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50.61 
 
 		 671 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  54.57 
 
 		 665 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  55.42 
 
 		 665 aa  672    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  100 
 
 		 668 aa  1369    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  49.78 
 
 		 668 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  633  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.05 
 
 		 668 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  49.93 
 
 		 668 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50 
 
 		 723 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  49.62 
 
 		 664 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  48.65 
 
 		 666 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  51.13 
 
 		 711 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.31 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  47.98 
 
 		 680 aa  628  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  53.19 
 
 		 675 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.9 
 
 		 669 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.77 
 
 		 665 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  48.97 
 
 		 681 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  49.02 
 
 		 670 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  49.24 
 
 		 668 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.22 
 
 		 664 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  48.41 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.25 
 
 		 668 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  51.27 
 
 		 670 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  49.62 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  50.22 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  50.22 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  49.85 
 
 		 670 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  49.85 
 
 		 670 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  47.9 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  48.95 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.04 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  47.9 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  47.9 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.05 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  49.1 
 
 		 664 aa  621  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  49.92 
 
 		 665 aa  621  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.68 
 
 		 680 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.38 
 
 		 665 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  48.72 
 
 		 664 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  47.9 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  49.32 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  49.12 
 
 		 674 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.05 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  48.72 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  49.54 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.2 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  49.62 
 
 		 672 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  48.72 
 
 		 664 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  48.8 
 
 		 664 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  48.67 
 
 		 690 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.75 
 
 		 673 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51 
 
 		 666 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  50.76 
 
 		 655 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  48.34 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  51.3 
 
 		 678 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  49.16 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  48.49 
 
 		 663 aa  614  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  49.01 
 
 		 667 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  48.72 
 
 		 664 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  49.78 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  49.01 
 
 		 667 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  48.85 
 
 		 667 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  49.01 
 
 		 667 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.25 
 
 		 667 aa  612  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.17 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  48.85 
 
 		 667 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  48.85 
 
 		 667 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  48.34 
 
 		 663 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  48.49 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>