More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0311 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3423  transketolase  56.69 
 
 		 668 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  100 
 
 		 665 aa  1339    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  55.91 
 
 		 668 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  96.99 
 
 		 665 aa  1288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  99.1 
 
 		 665 aa  1332    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  79.22 
 
 		 665 aa  1088    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  54.35 
 
 		 679 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.26 
 
 		 667 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  53.35 
 
 		 665 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53.37 
 
 		 682 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  55.57 
 
 		 668 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.84 
 
 		 678 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  51.65 
 
 		 668 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.17 
 
 		 675 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.62 
 
 		 674 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  48.27 
 
 		 660 aa  615  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.6 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.6 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.47 
 
 		 668 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  50.99 
 
 		 672 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  47.73 
 
 		 666 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  47.73 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  47.01 
 
 		 666 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.54 
 
 		 665 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  49.64 
 
 		 711 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.37 
 
 		 664 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.29 
 
 		 711 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  51.11 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  51.11 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  46.85 
 
 		 668 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.79 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  48.3 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  49.85 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.55 
 
 		 653 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  50.61 
 
 		 666 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  48.13 
 
 		 684 aa  591  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  51.06 
 
 		 662 aa  589  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.9 
 
 		 664 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.46 
 
 		 664 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.18 
 
 		 666 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  47.76 
 
 		 680 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.89 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  46.73 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.38 
 
 		 694 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  46.88 
 
 		 663 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.38 
 
 		 680 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.91 
 
 		 680 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.66 
 
 		 665 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.18 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  47.94 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.33 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  47.79 
 
 		 664 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.33 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.87 
 
 		 723 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.83 
 
 		 668 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.9 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.18 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  47.08 
 
 		 663 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  47.9 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.28 
 
 		 666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  47.9 
 
 		 664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.4 
 
 		 667 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  46.95 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  48.09 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.65 
 
 		 665 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.33 
 
 		 666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  47.94 
 
 		 664 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.33 
 
 		 666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  47.94 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  47.94 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  48.32 
 
 		 662 aa  581  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  46.81 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  46.78 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  46.74 
 
 		 659 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  46.61 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  48.21 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.27 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1981  transketolase  47.25 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  47.63 
 
 		 664 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  46.78 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  46.78 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  46.63 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  47.91 
 
 		 664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  48.2 
 
 		 665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  46.63 
 
 		 663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  46.73 
 
 		 663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.35 
 
 		 665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  47.04 
 
 		 665 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  47.76 
 
 		 664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  47.75 
 
 		 669 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.18 
 
 		 666 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  46.59 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  47.73 
 
 		 663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>