More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2348 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_17351  transketolase  48.18 
 
 		 669 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  60.41 
 
 		 698 aa  868    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.12 
 
 		 675 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  50.07 
 
 		 711 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  54.05 
 
 		 691 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.36 
 
 		 666 aa  690    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.36 
 
 		 666 aa  690    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  59.47 
 
 		 686 aa  831    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  50.66 
 
 		 660 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  50.74 
 
 		 670 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  50.15 
 
 		 723 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  49.48 
 
 		 664 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  51.84 
 
 		 671 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  50.93 
 
 		 676 aa  697    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  64.41 
 
 		 691 aa  905    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.19 
 
 		 674 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  696    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49.93 
 
 		 664 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  697    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  47.56 
 
 		 662 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  51.92 
 
 		 674 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  50 
 
 		 699 aa  663    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  50.93 
 
 		 676 aa  697    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  61.08 
 
 		 695 aa  846    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  51.18 
 
 		 681 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  47.99 
 
 		 707 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.51 
 
 		 666 aa  688    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.32 
 
 		 670 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  49.41 
 
 		 666 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  49.13 
 
 		 680 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  49.56 
 
 		 664 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  47.56 
 
 		 662 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.78 
 
 		 684 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  48.6 
 
 		 665 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  55.41 
 
 		 682 aa  748    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  49.13 
 
 		 680 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.19 
 
 		 674 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  696    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  47.28 
 
 		 668 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.13 
 
 		 668 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  58.45 
 
 		 707 aa  826    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  52.33 
 
 		 672 aa  685    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  50.29 
 
 		 741 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  62.68 
 
 		 691 aa  887    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  49.2 
 
 		 697 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  49.57 
 
 		 695 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  47.43 
 
 		 668 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  64.96 
 
 		 694 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  62.24 
 
 		 687 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.01 
 
 		 667 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  48.56 
 
 		 695 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  51.76 
 
 		 668 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  62.16 
 
 		 691 aa  885    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  58.48 
 
 		 697 aa  823    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.12 
 
 		 667 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  52.81 
 
 		 691 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.73 
 
 		 668 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  50.59 
 
 		 670 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.07 
 
 		 668 aa  698    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  49.26 
 
 		 672 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  62.16 
 
 		 691 aa  885    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  50.14 
 
 		 697 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  48.78 
 
 		 708 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  50.59 
 
 		 670 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  50 
 
 		 662 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  49.18 
 
 		 664 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  47.42 
 
 		 668 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  49.78 
 
 		 668 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  100 
 
 		 703 aa  1446    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  51.92 
 
 		 666 aa  689    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  52.81 
 
 		 691 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  63.94 
 
 		 694 aa  895    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  51.68 
 
 		 692 aa  688    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  49.71 
 
 		 666 aa  694    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.22 
 
 		 671 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  51.91 
 
 		 668 aa  734    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.07 
 
 		 711 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  51.76 
 
 		 678 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.95 
 
 		 669 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  53.27 
 
 		 688 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  48.06 
 
 		 701 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  47.81 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  48.35 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  46.26 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  46.57 
 
 		 670 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  46.86 
 
 		 670 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  48.01 
 
 		 725 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  48 
 
 		 741 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  47.48 
 
 		 659 aa  626  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  47.48 
 
 		 659 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  48.1 
 
 		 669 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  48.19 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>