More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2058 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2246  transketolase  64.04 
 
 		 708 aa  873    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1838  transketolase  64.4 
 
 		 758 aa  901    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000877092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19940  transketolase  66.91 
 
 		 725 aa  939    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1557  transketolase  62.33 
 
 		 702 aa  844    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  65.92 
 
 		 697 aa  947    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  68.86 
 
 		 708 aa  956    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2262  transketolase  64.9 
 
 		 707 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000167932  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2058  transketolase  100 
 
 		 741 aa  1496    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.96269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  67.78 
 
 		 697 aa  958    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1934  transketolase  66.32 
 
 		 722 aa  904    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2522  transketolase  62.77 
 
 		 699 aa  850    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3692  transketolase  59.28 
 
 		 697 aa  832    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1264  transketolase  63.02 
 
 		 706 aa  895    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.07 
 
 		 668 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  67.2 
 
 		 707 aa  945    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50 
 
 		 688 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  67.01 
 
 		 699 aa  959    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0902  transketolase  53.1 
 
 		 699 aa  724    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  67.6 
 
 		 695 aa  946    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  49.19 
 
 		 681 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  55.42 
 
 		 682 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2374  transketolase  64.04 
 
 		 695 aa  878    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  53.69 
 
 		 674 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  61.6 
 
 		 700 aa  844    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  50.29 
 
 		 703 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13210  transketolase  63.71 
 
 		 710 aa  904    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  67.44 
 
 		 741 aa  948    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  51.77 
 
 		 662 aa  644    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2161  transketolase  65.1 
 
 		 721 aa  888    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  68.7 
 
 		 697 aa  960    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2454  transketolase  59.85 
 
 		 697 aa  801    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  49.63 
 
 		 697 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  68.89 
 
 		 723 aa  944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  51.56 
 
 		 691 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2414  transketolase  59.85 
 
 		 697 aa  801    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.23 
 
 		 678 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15270  transketolase  60.72 
 
 		 698 aa  863    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0942256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  49.34 
 
 		 698 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  67.67 
 
 		 712 aa  961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  67.97 
 
 		 701 aa  952    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0442  transketolase  52.3 
 
 		 702 aa  711    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.369488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  49.93 
 
 		 711 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4785  transketolase  63.82 
 
 		 719 aa  880    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2097  transketolase  65.56 
 
 		 708 aa  914    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.718906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.07 
 
 		 711 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  51.56 
 
 		 691 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  50.97 
 
 		 667 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  68.24 
 
 		 692 aa  948    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  48.05 
 
 		 668 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11430  transketolase  62.46 
 
 		 724 aa  830    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  67.77 
 
 		 714 aa  936    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2460  transketolase  59.85 
 
 		 697 aa  801    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2720  transketolase  59.07 
 
 		 697 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0703691  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  51.85 
 
 		 691 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  50.15 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  47.9 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  47.32 
 
 		 707 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  47.9 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.11 
 
 		 666 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.19 
 
 		 668 aa  628  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  47.26 
 
 		 666 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  46.81 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.96 
 
 		 668 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  46.96 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  46.96 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.35 
 
 		 662 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  47.98 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  47.62 
 
 		 695 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  48.84 
 
 		 691 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  47.97 
 
 		 691 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  49.63 
 
 		 672 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.48 
 
 		 653 aa  611  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  48.22 
 
 		 670 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  47.75 
 
 		 687 aa  611  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.05 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  48.75 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  46.23 
 
 		 668 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  46.23 
 
 		 668 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  48.82 
 
 		 672 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  46.15 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  46.81 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.31 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  46.37 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  47.76 
 
 		 684 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  47.7 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  46.52 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  47.07 
 
 		 695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  49.63 
 
 		 669 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  46.23 
 
 		 668 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  47.8 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  47.12 
 
 		 669 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>