More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67105 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  63.13 
 
 		 684 aa  884    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  48.81 
 
 		 668 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  61.18 
 
 		 687 aa  853    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  54.44 
 
 		 670 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.93 
 
 		 670 aa  666    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.66 
 
 		 670 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.06 
 
 		 668 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  49.93 
 
 		 669 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.22 
 
 		 669 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.25 
 
 		 668 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.4 
 
 		 668 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.67 
 
 		 668 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  52.93 
 
 		 669 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.57 
 
 		 669 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  52.02 
 
 		 668 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  100 
 
 		 677 aa  1390    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29260  transketolase  51.95 
 
 		 684 aa  689    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.029788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  50.67 
 
 		 672 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.92 
 
 		 670 aa  678    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  54.44 
 
 		 670 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.07 
 
 		 670 aa  665    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.22 
 
 		 669 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  49.55 
 
 		 666 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  49.1 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.18 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.03 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.03 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  49.03 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.18 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.54 
 
 		 653 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.25 
 
 		 668 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  49.03 
 
 		 680 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  48.65 
 
 		 681 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  47.83 
 
 		 679 aa  612  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.73 
 
 		 666 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  48.01 
 
 		 678 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.79 
 
 		 662 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  47.45 
 
 		 668 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  49.24 
 
 		 661 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.66 
 
 		 666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  47.96 
 
 		 661 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  47.37 
 
 		 684 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  48.49 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  45.91 
 
 		 671 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  46.86 
 
 		 666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.08 
 
 		 665 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  48.87 
 
 		 663 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  46.41 
 
 		 666 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  46.85 
 
 		 674 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  48.49 
 
 		 659 aa  582  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  48.35 
 
 		 667 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  46.47 
 
 		 666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  46.47 
 
 		 666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  48.2 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.85 
 
 		 694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.92 
 
 		 664 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  46.58 
 
 		 662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  45.76 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  45.29 
 
 		 668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.27 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  48.26 
 
 		 682 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  47.07 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  47.07 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  47.07 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  47.07 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.71 
 
 		 668 aa  569  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  47.52 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  47.07 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  47.9 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  46.94 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  48.07 
 
 		 664 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  46.92 
 
 		 667 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  44.49 
 
 		 711 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  46.93 
 
 		 670 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  47.91 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  46.2 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  46.92 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  44.33 
 
 		 676 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  44.96 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  49.39 
 
 		 668 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  47.37 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  46.92 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  47.37 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  47.37 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  47.37 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  44.33 
 
 		 676 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  47.91 
 
 		 664 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  47.75 
 
 		 664 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  46.93 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0777  transketolase  45.95 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  47.37 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  47.4 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  47.53 
 
 		 665 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  45.35 
 
 		 657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  47.61 
 
 		 664 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  47.6 
 
 		 664 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  47.6 
 
 		 664 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  45.69 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>