More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3977 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 962 aa  1895    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 934 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 981 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 941 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  35.88 
 
 		 964 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.72 
 
 		 913 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 1088 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.1 
 
 		 1025 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 996 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 919 aa  373  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 1020 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 935 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 1022 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 990 aa  364  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 970 aa  361  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 1008 aa  361  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 940 aa  347  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 946 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 921 aa  339  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 908 aa  339  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 992 aa  336  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 1017 aa  331  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 907 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 1003 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 1027 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 1071 aa  326  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 		 1034 aa  326  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 931 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 1030 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.31 
 
 		 992 aa  320  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 1048 aa  319  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 		 1108 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 993 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 928 aa  313  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 965 aa  311  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 967 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 1013 aa  308  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 956 aa  308  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.9 
 
 		 971 aa  307  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 928 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.99 
 
 		 921 aa  303  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 990 aa  299  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.14 
 
 		 1014 aa  298  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 930 aa  298  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 963 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.82 
 
 		 1021 aa  297  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.28 
 
 		 1010 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 937 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 965 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33 
 
 		 950 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 954 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 1030 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  37.86 
 
 		 1138 aa  281  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.55 
 
 		 915 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 995 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  32.37 
 
 		 1025 aa  275  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.67 
 
 		 1022 aa  271  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 983 aa  270  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 926 aa  270  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 910 aa  268  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.09 
 
 		 1033 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 1003 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.38 
 
 		 790 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 989 aa  265  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 850 aa  264  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 775 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 632 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.12 
 
 		 788 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  35.67 
 
 		 775 aa  257  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 621 aa  257  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 654 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 1024 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 915 aa  253  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 1001 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 1033 aa  250  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  34.18 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.39 
 
 		 783 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 1346 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 806 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 982 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.21 
 
 		 981 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 910 aa  238  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 1003 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 814 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.22 
 
 		 941 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.69 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.57 
 
 		 631 aa  225  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 978 aa  221  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  38.65 
 
 		 1011 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  30.72 
 
 		 741 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 993 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 792 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  28.18 
 
 		 834 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.72 
 
 		 496 aa  209  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  35.61 
 
 		 453 aa  207  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  34.71 
 
 		 862 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  32.73 
 
 		 612 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>