More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0120 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 272 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  23.56 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  35.51 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 285 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 264 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.1 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 239 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 343 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 236 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  44.78 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  29.27 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>