More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 125 aa  247  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  69.11 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  48.41 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.23 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  41.48 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  41.22 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  38.69 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  36.22 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  40 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  41.86 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  41.73 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  40.16 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  35.61 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  37.01 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  39.69 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  34.35 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  34.85 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  56.6 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  35.07 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  34.11 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  32.31 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.04 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  30.6 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  46.94 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.09 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.47 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  45.1 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.51 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.62 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.55 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  48.98 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  32.58 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  50 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  38.81 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  29.71 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.62 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.66 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  51.92 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  43.28 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.62 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  36.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.71 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  49.06 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  36.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  31.11 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  42.31 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  41.67 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  43.14 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  43.24 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.47 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  50 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  34.38 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  43.94 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  46.94 
 
 		 280 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.86 
 
 		 314 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.04 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  49.02 
 
 		 221 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.46 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  40.38 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.46 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  42.86 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  40.38 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.48 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5002  UspA domain-containing protein  48.98 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.81 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.46 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.38 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  35.38 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  43.75 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  32.05 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  39.06 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  45.9 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  39.06 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  38.78 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.73 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  42 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>