More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1112.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.2 
 
 		 667 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.2 
 
 		 667 aa  904    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112.1  chemotactic transducer  100 
 
 		 500 aa  1030    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.6 
 
 		 667 aa  909    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89 
 
 		 667 aa  912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.8 
 
 		 666 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.6 
 
 		 667 aa  956    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.2 
 
 		 667 aa  905    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.6 
 
 		 667 aa  954    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.6 
 
 		 667 aa  955    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.4 
 
 		 665 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.65 
 
 		 628 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.65 
 
 		 628 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  28.88 
 
 		 632 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.67 
 
 		 632 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.75 
 
 		 630 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.02 
 
 		 643 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.3 
 
 		 630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.12 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.46 
 
 		 623 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 		 626 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  28.91 
 
 		 629 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  25.78 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.26 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  26.61 
 
 		 623 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.14 
 
 		 626 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.02 
 
 		 625 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.33 
 
 		 623 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.33 
 
 		 623 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 		 622 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  26.33 
 
 		 629 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.15 
 
 		 629 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  24.7 
 
 		 624 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27 
 
 		 623 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  28.38 
 
 		 629 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  26.07 
 
 		 629 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.97 
 
 		 623 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.73 
 
 		 624 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  23.65 
 
 		 629 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.97 
 
 		 623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.97 
 
 		 623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  25.83 
 
 		 629 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26 
 
 		 623 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.3 
 
 		 632 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  25.81 
 
 		 639 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  25.91 
 
 		 633 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.56 
 
 		 622 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  26.23 
 
 		 652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.85 
 
 		 624 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  23.21 
 
 		 623 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.53 
 
 		 624 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  25.53 
 
 		 624 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 		 645 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.78 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.11 
 
 		 622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  26.58 
 
 		 627 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 713 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  26.01 
 
 		 627 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  25.62 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  24.13 
 
 		 623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.86 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.73 
 
 		 630 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.06 
 
 		 630 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.06 
 
 		 630 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 645 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 		 653 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.27 
 
 		 630 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 		 645 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.66 
 
 		 630 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  25.25 
 
 		 626 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 		 645 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  25.46 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 630 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 626 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.72 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 548 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.49 
 
 		 716 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.27 
 
 		 626 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  23.26 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.18 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.32 
 
 		 609 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.18 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.67 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 		 652 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  22.99 
 
 		 646 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 546 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 545 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.24 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3985  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 653 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  23.04 
 
 		 626 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 545 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.41 
 
 		 655 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  27.15 
 
 		 628 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 545 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 653 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>