More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0946 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.92 
 
 		 666 aa  919    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.1 
 
 		 667 aa  1205    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.1 
 
 		 667 aa  1349    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112.1  chemotactic transducer  94.6 
 
 		 500 aa  954    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.6 
 
 		 667 aa  1230    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1360    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.4 
 
 		 667 aa  1353    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.1 
 
 		 667 aa  1204    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.1 
 
 		 667 aa  1204    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.1 
 
 		 667 aa  1204    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.66 
 
 		 665 aa  943    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.36 
 
 		 630 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  28.82 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 622 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.81 
 
 		 630 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  30.62 
 
 		 632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 628 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.63 
 
 		 628 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 623 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.02 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 		 623 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.29 
 
 		 643 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  32.02 
 
 		 652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  29.95 
 
 		 624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.4 
 
 		 626 aa  234  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 		 626 aa  233  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 623 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.37 
 
 		 623 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.37 
 
 		 623 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  29.49 
 
 		 623 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.14 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 		 626 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 		 622 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.66 
 
 		 626 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.8 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 		 629 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.83 
 
 		 628 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  31.18 
 
 		 639 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.84 
 
 		 623 aa  224  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.73 
 
 		 626 aa  223  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  29.48 
 
 		 623 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.74 
 
 		 629 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  28.77 
 
 		 626 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.19 
 
 		 626 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  30.04 
 
 		 623 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 645 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 625 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 		 630 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  31.1 
 
 		 630 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  29 
 
 		 627 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.41 
 
 		 622 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 		 629 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.61 
 
 		 629 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 630 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.62 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 548 aa  218  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 623 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 		 630 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  30.61 
 
 		 643 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  29.87 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 		 645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  29.96 
 
 		 627 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 630 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 645 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.29 
 
 		 630 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  39.21 
 
 		 628 aa  213  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.91 
 
 		 627 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 713 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 636 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  28.25 
 
 		 629 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  32.39 
 
 		 628 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  28.82 
 
 		 626 aa  212  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 634 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 		 626 aa  211  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 		 654 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 638 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  28.08 
 
 		 629 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.53 
 
 		 624 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 671 aa  210  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  28.63 
 
 		 697 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  29.41 
 
 		 629 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 637 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.71 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 545 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 554 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  32.13 
 
 		 623 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.32 
 
 		 716 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 545 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 545 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.81 
 
 		 554 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>