More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2528 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.81 
 
 		 667 aa  969    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.06 
 
 		 667 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.36 
 
 		 667 aa  951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112.1  chemotactic transducer  69.4 
 
 		 500 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 665 aa  1350    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.07 
 
 		 666 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0934  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.06 
 
 		 667 aa  948    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.66 
 
 		 667 aa  963    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.231949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.76 
 
 		 667 aa  944    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.386472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.66 
 
 		 667 aa  966    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.66 
 
 		 667 aa  966    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.8 
 
 		 632 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  29.46 
 
 		 632 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.84 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.32 
 
 		 630 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  31.54 
 
 		 624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.89 
 
 		 630 aa  243  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.77 
 
 		 639 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 628 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  33.2 
 
 		 629 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.05 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.29 
 
 		 628 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 623 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 629 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.85 
 
 		 626 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 630 aa  236  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 623 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 		 629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  31.65 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  30.88 
 
 		 629 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  30.46 
 
 		 629 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 630 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 622 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 637 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.29 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.2 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  29.72 
 
 		 629 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 		 625 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.01 
 
 		 626 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.6 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 630 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 645 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  31.42 
 
 		 652 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 628 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  31.1 
 
 		 626 aa  227  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  32.46 
 
 		 623 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.71 
 
 		 626 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  28.7 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.03 
 
 		 623 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.03 
 
 		 623 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 645 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 716 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  29.49 
 
 		 627 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 674 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.6 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 636 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  30.64 
 
 		 628 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.13 
 
 		 632 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 630 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 		 564 aa  220  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 623 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 		 634 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.94 
 
 		 629 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 626 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  32.72 
 
 		 712 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 631 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.01 
 
 		 634 aa  216  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 548 aa  216  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  29.8 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 568 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 622 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.4 
 
 		 645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  30.21 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 738 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.21 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.72 
 
 		 712 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 627 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.25 
 
 		 645 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.44 
 
 		 646 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 		 630 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  38.66 
 
 		 545 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 541 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 688 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 559 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.41 
 
 		 624 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 570 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  31.68 
 
 		 623 aa  207  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>