More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3100 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
652 aa  1329    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36.15 
 
 
648 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 
646 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 
647 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.67 
 
 
647 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 
646 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.95 
 
 
647 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
648 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
655 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
629 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 
671 aa  326  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.87 
 
 
630 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.4 
 
 
630 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.584827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.45 
 
 
668 aa  277  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 
695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00207311  hitchhiker  0.0002457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.74 
 
 
695 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0484461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
695 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.84 
 
 
688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.638293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.71 
 
 
697 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.26 
 
 
626 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.43 
 
 
698 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.65 
 
 
643 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 
625 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  31.48 
 
 
629 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.28 
 
 
630 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  31.33 
 
 
626 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.28 
 
 
630 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  26.82 
 
 
660 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  25.82 
 
 
712 aa  224  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 
628 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  30.61 
 
 
629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 
629 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 
622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  29.8 
 
 
629 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.97 
 
 
549 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.54 
 
 
628 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.48 
 
 
624 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 
660 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.11 
 
 
624 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.03 
 
 
629 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  29.61 
 
 
629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  30.77 
 
 
623 aa  218  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  26.76 
 
 
729 aa  216  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  26.31 
 
 
650 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  26.31 
 
 
650 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.93 
 
 
624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.61 
 
 
626 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  26.16 
 
 
660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.78 
 
 
624 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.98 
 
 
630 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 
626 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.98 
 
 
632 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  26.2 
 
 
660 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
549 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 
622 aa  211  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  30.5 
 
 
652 aa  210  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  32.34 
 
 
623 aa  210  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.62 
 
 
549 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  26.17 
 
 
650 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.45 
 
 
650 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 
660 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  30.04 
 
 
632 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  29.68 
 
 
632 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.95 
 
 
630 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 
630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.38 
 
 
630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 
630 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 
660 aa  204  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
630 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  26.64 
 
 
660 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
630 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.62 
 
 
660 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 
660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 
645 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
545 aa  200  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 
660 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 
627 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  29.22 
 
 
624 aa  198  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  24.53 
 
 
658 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  24.53 
 
 
658 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  26.38 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
660 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.57 
 
 
660 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.29 
 
 
645 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  29.47 
 
 
627 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  27.66 
 
 
660 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  24.38 
 
 
658 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  24.38 
 
 
658 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 
629 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  27.82 
 
 
660 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.32 
 
 
696 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
546 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>