121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1512 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 561 aa  1144    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  65.16 
 
 		 572 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.56 
 
 		 1108 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  30.16 
 
 		 1097 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  31.45 
 
 		 1094 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.69 
 
 		 1095 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  30.2 
 
 		 1083 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.92 
 
 		 999 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28 
 
 		 1204 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.89 
 
 		 1145 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.4 
 
 		 1163 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 309 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  31.69 
 
 		 1109 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 349 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 1111 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 1190 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 1116 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 1064 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 		 1126 aa  90.9  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.02 
 
 		 1056 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 		 1061 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  28.69 
 
 		 661 aa  87  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 1193 aa  87  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  27.56 
 
 		 1018 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 349 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.52 
 
 		 1118 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.52 
 
 		 1118 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  24.21 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  28.08 
 
 		 1044 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  28.27 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  29.2 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  25.9 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  23.51 
 
 		 376 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 1050 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.78 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  23.98 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.91 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 		 992 aa  73.9  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  24.8 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  27.91 
 
 		 1145 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.61 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1217 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.04 
 
 		 392 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.19 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  26.27 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  24.6 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  28.17 
 
 		 1025 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  22.46 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.58 
 
 		 1139 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 1089 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  20.75 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28 
 
 		 1055 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  28.64 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 		 991 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 		 1075 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 1216 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  29.2 
 
 		 1119 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  24.7 
 
 		 1013 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  22.91 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.11 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  23.02 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.61 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 446 aa  57  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  23.53 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  28.1 
 
 		 990 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.87 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  27.65 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 654 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  27.4 
 
 		 971 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.12 
 
 		 1733 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2121  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.21 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 968 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.91 
 
 		 1183 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  29.88 
 
 		 997 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  21.88 
 
 		 713 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  24.62 
 
 		 349 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  28.18 
 
 		 1102 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  25.68 
 
 		 985 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.26 
 
 		 907 aa  50.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  23.81 
 
 		 1020 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  28.25 
 
 		 1101 aa  50.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 1141 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  24.27 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  26.98 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  25.11 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.92 
 
 		 831 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  20.83 
 
 		 1034 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>