More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55128 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  879    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.28 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  27 
 
 		 449 aa  93.2  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  27.3 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  28.08 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1451  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 465 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.815185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  26.23 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0069  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44222  enhanced disease susceptibility 5-like protein  34.8 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  27.72 
 
 		 555 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  28.29 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  26.89 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28091  MOP(MATE) family transporter  27.27 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0057098  normal  0.084674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  26.53 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  32.45 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4334  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210816  normal  0.91675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0061  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.871817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.08 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  32.65 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  28.42 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.58 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  29.55 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  27.91 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  26.36 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  23.43 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  28.8 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.92 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  23.61 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0403  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  27.08 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.71 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.14 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.86 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.46 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  22.64 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0896  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0613531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>