More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35587 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1122    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87197  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  40.09 
 
 		 490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  28.69 
 
 		 560 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  30.59 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  28.53 
 
 		 446 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  27.53 
 
 		 451 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 460 aa  94.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.92 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 448 aa  90.5  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  26.27 
 
 		 438 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  27.4 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  27.98 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  32 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02855  hypothetical protein  26.2 
 
 		 445 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0753  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3961  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4658  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.872929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.39 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.9 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2317  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.816192  normal  0.0947968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_004310  BR0310  DNA-damage-inducible protein F, putative  24.94 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0324  putative DNA-damage-inducible protein F  24.94 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.315939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  22.75 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2085  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0451278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2131  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0258983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.31 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2068  MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  23.59 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  22.34 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  26.98 
 
 		 434 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  33.16 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0160  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.62 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  24.26 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  21.41 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0160  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  21.78 
 
 		 446 aa  57  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2863  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.277434  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  23.15 
 
 		 443 aa  57  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 477 aa  57  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.12 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 473 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.45 
 
 		 464 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0614  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166177 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.42 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  24.57 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 441 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  25.56 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 505 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 470 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 458 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>