290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0650 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  66.86 
 
 		 1536 aa  2044    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  44.72 
 
 		 1356 aa  731    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  60.08 
 
 		 1557 aa  1851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  64.22 
 
 		 1538 aa  1915    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  100 
 
 		 1534 aa  3119    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  45.15 
 
 		 1102 aa  629  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  44.9 
 
 		 1102 aa  624  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  44.87 
 
 		 1107 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  44.37 
 
 		 1123 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  44.01 
 
 		 1100 aa  611  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  44.1 
 
 		 1107 aa  609  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  43.58 
 
 		 1100 aa  606  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  45.21 
 
 		 1245 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.69 
 
 		 1098 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.23 
 
 		 1105 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.32 
 
 		 1098 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  38.58 
 
 		 952 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.21 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.98 
 
 		 1095 aa  447  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  38.07 
 
 		 952 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  38.95 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  38.82 
 
 		 1034 aa  440  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  38.46 
 
 		 998 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  38.34 
 
 		 974 aa  438  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  38.68 
 
 		 998 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  37.78 
 
 		 1039 aa  437  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  38.19 
 
 		 982 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  39.38 
 
 		 1025 aa  432  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  38.66 
 
 		 985 aa  429  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  38.19 
 
 		 976 aa  426  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  38.19 
 
 		 976 aa  426  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  38.73 
 
 		 968 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  38.11 
 
 		 1006 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  38.26 
 
 		 1000 aa  409  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  38.26 
 
 		 1000 aa  409  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  37.44 
 
 		 1034 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  30.77 
 
 		 881 aa  318  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  30.59 
 
 		 879 aa  316  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  30.19 
 
 		 1168 aa  268  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  41.37 
 
 		 907 aa  244  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  37.18 
 
 		 1093 aa  193  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  42.51 
 
 		 267 aa  168  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  30.8 
 
 		 918 aa  166  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  37.25 
 
 		 726 aa  157  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  35.22 
 
 		 730 aa  142  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  31.11 
 
 		 719 aa  135  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  30.94 
 
 		 544 aa  129  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  31.91 
 
 		 465 aa  128  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  36.75 
 
 		 361 aa  128  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  30.99 
 
 		 1174 aa  127  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  30.83 
 
 		 1184 aa  126  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  28.39 
 
 		 447 aa  126  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  31.51 
 
 		 673 aa  125  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  32.91 
 
 		 501 aa  122  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  32.07 
 
 		 506 aa  121  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  29.76 
 
 		 981 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  27.49 
 
 		 1481 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  32.17 
 
 		 498 aa  115  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  30.41 
 
 		 1175 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  31.55 
 
 		 1176 aa  110  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  24.25 
 
 		 1112 aa  107  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  26.68 
 
 		 1231 aa  104  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  30.93 
 
 		 1836 aa  102  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  25.37 
 
 		 1549 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  26.78 
 
 		 1797 aa  101  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  32.97 
 
 		 766 aa  101  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  33.72 
 
 		 467 aa  100  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  30.52 
 
 		 1523 aa  98.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  30.52 
 
 		 1523 aa  98.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  26.94 
 
 		 717 aa  96.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  26.94 
 
 		 717 aa  96.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  26.94 
 
 		 717 aa  96.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  27.27 
 
 		 872 aa  95.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  28.18 
 
 		 1170 aa  95.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  32.05 
 
 		 498 aa  94.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  32.79 
 
 		 926 aa  94  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  24.94 
 
 		 710 aa  93.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  28.26 
 
 		 866 aa  92.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  27.03 
 
 		 1189 aa  92.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  25.73 
 
 		 1623 aa  92  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  29.37 
 
 		 407 aa  89.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  27.93 
 
 		 1386 aa  89.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  29.87 
 
 		 946 aa  87.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  29.47 
 
 		 637 aa  86.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  26.65 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.41 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  26.42 
 
 		 1683 aa  84  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  27.83 
 
 		 2090 aa  83.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  32.98 
 
 		 964 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  26.28 
 
 		 1980 aa  82.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  25.47 
 
 		 747 aa  83.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  27.86 
 
 		 1955 aa  82.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  31.33 
 
 		 310 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  30.54 
 
 		 982 aa  79.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.16 
 
 		 1665 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  38.24 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.68 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  28.43 
 
 		 1952 aa  79  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  29.86 
 
 		 516 aa  78.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  27.74 
 
 		 740 aa  78.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>