More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1405 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  64.95 
 
 		 295 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  40.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  34.75 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.1 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>