159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3159 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  88.3 
 
 		 282 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  87.94 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  60.33 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  64.57 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  48.52 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.54 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.6 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  46.69 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  48.58 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  45.27 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  50.21 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  49.78 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  48.66 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 268 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  43.94 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  44.26 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  44.21 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  44.95 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 273 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.75 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28.42 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  35.45 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 621 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  37.25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  37.25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  37.25 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.22 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 		 572 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 607 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 		 677 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 864 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 621 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 621 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 629 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.25 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 594 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 610 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.78 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 585 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 543 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 714 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.6 
 
 		 565 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 592 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 582 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  29.68 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 		 610 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 2651 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 579 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 767 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1714 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 566 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 595 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26 
 
 		 623 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 542 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.54 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 612 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 589 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  28.44 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  35.35 
 
 		 615 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 		 955 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 617 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.34 
 
 		 762 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 667 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 870 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 452 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 573 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.34 
 
 		 762 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 563 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.53 
 
 		 430 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.19 
 
 		 603 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  34.97 
 
 		 397 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 1979 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  39.77 
 
 		 520 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.09 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 620 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.22 
 
 		 587 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 716 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 927 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  22.78 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 		 614 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>