99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5405 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  88.13 
 
 		 514 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  92.41 
 
 		 514 aa  937    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  91.44 
 
 		 514 aa  929    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  99.81 
 
 		 514 aa  1003    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1004    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  52.25 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  47.67 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  46.88 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  44.76 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  42.95 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.98 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  42.64 
 
 		 284 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  38.58 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  40.46 
 
 		 285 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  40.46 
 
 		 285 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  42.27 
 
 		 287 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  39.53 
 
 		 273 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  38.43 
 
 		 296 aa  153  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  27.01 
 
 		 558 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  37.26 
 
 		 287 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.03 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.34 
 
 		 541 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  37.55 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  36.05 
 
 		 276 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  35.74 
 
 		 289 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  34.75 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  32.62 
 
 		 282 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  33.74 
 
 		 607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.11 
 
 		 262 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  37.45 
 
 		 273 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.52 
 
 		 517 aa  126  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.4 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.68 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  30.11 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.35 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.39 
 
 		 510 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  33.46 
 
 		 332 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 304 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.72 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.32 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  32.07 
 
 		 261 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.68 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  31.98 
 
 		 271 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.05 
 
 		 304 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  25.87 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  34.62 
 
 		 280 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.03 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.9 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  26.63 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  25.07 
 
 		 974 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  32.82 
 
 		 266 aa  98.2  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.89 
 
 		 272 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  33.89 
 
 		 320 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  29.57 
 
 		 262 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  30.43 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  30.99 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.76 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  30.68 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  28.42 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.79 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.96 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  27.92 
 
 		 339 aa  70.1  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  23.79 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.07 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  28.14 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  31.58 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  31.58 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  32.48 
 
 		 876 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  39.08 
 
 		 678 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.37 
 
 		 835 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.34 
 
 		 1078 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.13 
 
 		 1078 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  24.45 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  29.78 
 
 		 991 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1079 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.39 
 
 		 1017 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  29.79 
 
 		 844 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  32.2 
 
 		 752 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  24.86 
 
 		 803 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  30.23 
 
 		 982 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  23.86 
 
 		 819 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  29.47 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.65 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  32 
 
 		 735 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  27.41 
 
 		 782 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  25.5 
 
 		 257 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  25 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  28.37 
 
 		 759 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.11 
 
 		 744 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  27.21 
 
 		 278 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  24.15 
 
 		 836 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  31.53 
 
 		 759 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>