More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0484 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1148 aa  2240    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  37.3 
 
 		 1172 aa  592  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1171 aa  426  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.98 
 
 		 1146 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  29.42 
 
 		 1175 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  29.44 
 
 		 1174 aa  405  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1188 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1184 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 		 1192 aa  389  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  28.1 
 
 		 1149 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  28.22 
 
 		 1193 aa  383  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  28.45 
 
 		 1147 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 		 1189 aa  376  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  28.61 
 
 		 1226 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  27.86 
 
 		 1196 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  29.81 
 
 		 1189 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1226 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 		 1146 aa  365  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.73 
 
 		 1191 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  29.22 
 
 		 1189 aa  360  9e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 		 1204 aa  343  8e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.85 
 
 		 1207 aa  342  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.69 
 
 		 1196 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.08 
 
 		 1196 aa  331  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.53 
 
 		 1187 aa  325  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1177 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  27.87 
 
 		 1196 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.48 
 
 		 1194 aa  312  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  25.91 
 
 		 1202 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1187 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.64 
 
 		 1201 aa  311  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.81 
 
 		 1185 aa  308  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.85 
 
 		 1174 aa  301  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.38 
 
 		 1190 aa  301  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 		 1189 aa  301  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  26.54 
 
 		 1183 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.87 
 
 		 1189 aa  299  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  24.88 
 
 		 1199 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  24.92 
 
 		 1199 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.86 
 
 		 1199 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.46 
 
 		 1189 aa  288  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.35 
 
 		 1189 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  26.32 
 
 		 1189 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.65 
 
 		 1179 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  26.03 
 
 		 1189 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  26.23 
 
 		 1189 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  26.23 
 
 		 1189 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  26.03 
 
 		 1189 aa  284  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  26.03 
 
 		 1189 aa  284  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  26.15 
 
 		 1189 aa  283  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 		 1185 aa  282  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 		 1188 aa  281  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 		 1188 aa  281  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.09 
 
 		 1185 aa  279  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.89 
 
 		 1190 aa  278  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.37 
 
 		 1186 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  29.97 
 
 		 1190 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 		 1185 aa  271  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.66 
 
 		 1191 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1217 aa  267  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  30.15 
 
 		 1208 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1153 aa  260  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1146 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.87 
 
 		 1184 aa  257  9e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.66 
 
 		 1180 aa  257  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.16 
 
 		 1198 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.15 
 
 		 1178 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.64 
 
 		 1187 aa  253  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.57 
 
 		 1174 aa  252  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1170 aa  252  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.79 
 
 		 1177 aa  251  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  22.85 
 
 		 1185 aa  251  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.92 
 
 		 1179 aa  249  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1164 aa  248  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  23.51 
 
 		 1134 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1184 aa  244  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.61 
 
 		 1170 aa  243  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  25.78 
 
 		 1476 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  31.74 
 
 		 1196 aa  241  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  23.28 
 
 		 1177 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.54 
 
 		 1209 aa  240  9e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 		 1177 aa  240  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 		 1148 aa  239  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.04 
 
 		 1181 aa  239  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.98 
 
 		 1174 aa  238  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 		 1178 aa  238  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  25.21 
 
 		 1171 aa  237  8e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  25.06 
 
 		 1176 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  22.96 
 
 		 1173 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  25.87 
 
 		 1240 aa  235  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  24.67 
 
 		 1176 aa  235  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1186 aa  234  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  24.63 
 
 		 981 aa  229  3e-58  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  25.57 
 
 		 1225 aa  229  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.99 
 
 		 1179 aa  226  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  23.26 
 
 		 1168 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.78 
 
 		 1215 aa  214  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  23.59 
 
 		 1167 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  28.08 
 
 		 1219 aa  208  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>