218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2330 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  44.35 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  45.97 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.8 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  32.55 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  35.86 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  35.09 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  26.03 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  24.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  26 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  21.77 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>