296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0930 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
173 aa  343  7e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  83.14 
 
 
175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  55.09 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  31.55 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  33.54 
 
 
201 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  37.79 
 
 
198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  30.36 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  36.59 
 
 
173 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  32.76 
 
 
187 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  35.29 
 
 
173 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  30.23 
 
 
188 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  32.72 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  34.32 
 
 
176 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  34.15 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  32.54 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  34.91 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  32.34 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  32.34 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  31.48 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  32.37 
 
 
185 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  32.1 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 
231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  34.78 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 
189 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 
189 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  28.14 
 
 
204 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  31.01 
 
 
189 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  29.24 
 
 
200 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3353  16S rRNA-processing protein RimM  29.3 
 
 
173 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  32.75 
 
 
191 aa  101  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0633  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 
224 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3681  16S rRNA-processing protein RimM  26.99 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  27.98 
 
 
221 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0654  16S rRNA-processing protein RimM  29.34 
 
 
223 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0665  16S rRNA-processing protein RimM  29.34 
 
 
223 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0329294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3277  16S rRNA processing protein RimM  28.18 
 
 
188 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399714  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  34.3 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  29.61 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  34.68 
 
 
179 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  27.65 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  26.88 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  29.66 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  26.25 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2152  16S rRNA processing protein RimM  26.95 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.523891  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  32.16 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  30.77 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  32.16 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  23.95 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1255  16S rRNA-processing protein RimM  29.31 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000136012  hitchhiker  0.0000512506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  25.62 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  24.69 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  31.76 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  22.86 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2485  16S rRNA processing protein RimM  22.54 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423168  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  31.76 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1064  16S rRNA-processing protein RimM  30.18 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154206  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  23.03 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  27.54 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  26.51 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  23.53 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  23.64 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  23.95 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  25.3 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2753  16S rRNA-processing protein RimM  28.14 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000227208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1578  16S rRNA-processing protein RimM  27.52 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.637772  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2005  16S rRNA processing protein RimM  23.67 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000559239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  28.64 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  21.82 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1050  16S rRNA-processing protein RimM  28.16 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  21.18 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  24.39 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1160  16S rRNA-processing protein RimM  28.16 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2919  16S rRNA-processing protein RimM  27.65 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01706  16S rRNA-processing protein RimM  28.19 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0345877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  26.42 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  26.63 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  26.42 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  23.21 
 
 
210 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  23.64 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  25.7 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2018  16S rRNA processing protein RimM  24.26 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0112237  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  32.32 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  20.57 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2837  16S rRNA-processing protein RimM  28.57 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499984  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2919  16S rRNA-processing protein RimM  28.57 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000363709  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3366  16S rRNA processing protein RimM  28.65 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  22.22 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2321  16S rRNA processing protein RimM  24.26 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3016  16S rRNA-processing protein RimM  27.98 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000828768  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  23.12 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  27.67 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  23.64 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  23.42 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>