241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0124 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  33.13 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  33.13 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  31.71 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  31.74 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  32.74 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  31.71 
 
 		 182 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  30.54 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  34.68 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  30.36 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3015  16S rRNA-processing protein RimM  30.99 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00120588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  31.37 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  28.66 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  28.66 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  25.73 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2307  16S rRNA processing protein RimM  26.16 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00013128  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  27.54 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  30.86 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  25.77 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  25.73 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3761  16S rRNA processing protein RimM  29.41 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000217474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  24.4 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  32.03 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  27.65 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0088  16S rRNA-processing protein RimM  29.76 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  31.76 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  31.74 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  29.07 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  27.65 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  33.53 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1094  16S rRNA processing protein RimM  25.45 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000169759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  32.86 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  31.98 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0074  16S rRNA-processing protein RimM  29.17 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  28.49 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1154  16S rRNA-processing protein RimM  31.33 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  28.24 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  26.16 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  31.91 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  29.71 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  27.71 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0322  16S rRNA processing protein RimM  25.45 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00023377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  31.55 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  29.52 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  29.09 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  30.23 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  31.69 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  30.38 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1301  16S rRNA processing protein RimM  24.68 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0244939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1390  16S rRNA processing protein RimM  31.71 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2051  16S rRNA processing protein RimM  24.85 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  30.19 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  30.19 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0848  16S rRNA processing protein RimM  25.75 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  36.89 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0428  16S rRNA processing protein RimM  27.81 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  28.48 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3769  16S rRNA processing protein RimM  27.11 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000183564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  28.82 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  30.19 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  28.48 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0365  16S rRNA processing protein RimM  23.67 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000438185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  30.07 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0648  16S rRNA processing protein RimM  26.32 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  29.56 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2782  16S rRNA processing protein RimM  27.91 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  29.22 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  23.98 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  24.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2259  16S rRNA processing protein RimM  27.11 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  27.06 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  25.29 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  25.29 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  26.59 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1009  16S rRNA processing protein RimM  29.86 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144074  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  28.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  28.95 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  26.79 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  25.93 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  25.97 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  25.93 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0551  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.44188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1630  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000568977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  29.56 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  27.54 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  32.71 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0885  16S rRNA processing protein RimM  29.24 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  26.51 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  27.44 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  26.97 
 
 		 233 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3680  16S rRNA processing protein RimM  25.77 
 
 		 211 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  27.38 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  24.55 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0570  16S rRNA-processing protein RimM  28.92 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>