More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4627 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
208 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  51.92 
 
 
207 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  51.22 
 
 
186 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  50.49 
 
 
233 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  50.73 
 
 
186 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  47.6 
 
 
217 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  46.86 
 
 
182 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  44.88 
 
 
180 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  41.75 
 
 
181 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  39.81 
 
 
176 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  39.81 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  39.02 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  40.38 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  40.1 
 
 
177 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  37.32 
 
 
179 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  37.32 
 
 
179 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  37.32 
 
 
179 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  33.49 
 
 
179 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38467  predicted protein  33.03 
 
 
235 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  29.7 
 
 
171 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  28.08 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  28.85 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  28.02 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  28.64 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  28.43 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  29.9 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  25.84 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  26.47 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  27.18 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  32.61 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  26.83 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  25.48 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  32.9 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  31.16 
 
 
244 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  26.96 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43626  predicted protein  27.14 
 
 
341 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000259713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2976  16S rRNA-processing protein RimM  36 
 
 
248 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470421  normal  0.0518366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  26.92 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  28.43 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  28.43 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  26.7 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  28.78 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  31.43 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  28.02 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  28.02 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  28.02 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  27.45 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  28.78 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  30.54 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  30.19 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  28.08 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2233  16S rRNA-processing protein RimM  31.09 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347388  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  27.7 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  26.47 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1016  16S rRNA processing protein RimM  32.89 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000810353  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  24.64 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  25.38 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  27.44 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  28.97 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  25.12 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  35.82 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  30.05 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  26.76 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0749  16S rRNA-processing protein RimM  30.77 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  27.8 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  29.71 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  35.82 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0992  16S rRNA-processing protein RimM  32.41 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0518  16S rRNA processing protein RimM  31.36 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.541026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  26.96 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  35.82 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  36.76 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3366  16S rRNA processing protein RimM  34.76 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  27.05 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  23.19 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  26.76 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  27.31 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1397  16S rRNA processing protein RimM  32.5 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000193621  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  28.17 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  25.62 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  29 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3065  16S rRNA processing protein RimM  33.78 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508882  hitchhiker  0.000000546045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  29.58 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  29 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  23.67 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  23.67 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  23.67 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1289  16S rRNA processing protein RimM  29.68 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611954  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  23.67 
 
 
171 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  23.67 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0950  16S rRNA-processing protein RimM  29.53 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0770  16S rRNA-processing protein RimM  36 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0946  16S rRNA-processing protein RimM  29.53 
 
 
237 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  26.79 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1070  16S rRNA-processing protein RimM  28.27 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0584634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10990  16S rRNA processing protein RimM  23.44 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000722638  unclonable  0.00000000154535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  25.37 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  31.65 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>